Le génome des Tuberaceae : analyse fonctionnelle des séquences exprimées durant la morphogénèse de Tuber borchii Vittad.

par Silvia Gabella

Thèse de doctorat en Biologie végétale et forestièreBiologie végétale et forestière

Sous la direction de Francis Martin.

Soutenue en 2004

à Nancy 1 en cotutelle avec l'Università degli studi (Torino, Italia) , en partenariat avec Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques (autre partenaire) .


  • Résumé

    La formation de l'ascocarpe des truffes conduit à des modifications de leur taille, de l'organisation cellulaire et de la production des arômes. La réalisation de deux banques d'ADNc à partir de fructifications à deux stades de maturation différent a permis la production de 2043 clones d'ADNc et de 641 ESTs. La comparaison de l'expression génique sur filtre d'ADNc dans le mycélium et dans différents stades de maturation de l'ascocarpe montre que : 1) la majorité des gènes régulés lors de la formation de l'ascocarpe ont une fonction inconnue ; 2) un certain nombre de transcrits codent pour des enzymes impliquées dans les voies du métabolisme primaire et secondaire ; 3) des gènes impliqués dans la résistance aux stress sont les plus stimulés. Enfin, la caractérisation d'un EST de T. Borchii présentant une similarité avec le gène bli-3 de Neurospora crassa suggère que la truffe perçoit la lumière.


  • Résumé

    The ripening of a truffle fruitbody leads to drastic changes in its size, morphology, cellular organization and aroma production. To explore the gene expression in Tuber borchii during fruitbody development, cDNA libraries from fruitbodies at two stages of maturation were constructed, 3000 cDNA clones were isolated, 2043 were used for constructing cDNA arrays and 641 ESTs of high quality were produced. The results demonstrate that 1) the molecular machinery which allows the truffle ripening mostly consists of orphan genes; 2) truffles have an intense metabolism where pathways belonging to the primary and secondary metabolism are active; 3) some stress-related genes can be identified as markers for fruitbody formation. Furthermore the expression pattern of a cDNA sequence, isolated from ripe fruitbody, showing a good similarity to a Neurospora crassa blue-light inducible gene, was studied using Real-Time RT-PCR assay. The data obtained suggest a light-dependent response in T. Borchii.

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Informations

  • Détails : 1 vol.(158 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. p. 145-158

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