Analogues et dérivés des méridianines : Synthèse et Étude structure-activité biologique

par Gaëlle Simon

Thèse de doctorat en Chimie fine

Sous la direction de Bernard Corbel.

Soutenue en 2004

à Brest .

mots clés

• Indole
• Pyrimidines
• Énamines

Résumé

Le milieu marin est une source de molécules bioactives originales. Les méridianines, indoles substitués en position 3 par un reste pyrimidine, font partie de ces molécules découvertes récemment qui présentent une activité inhibitrice des kinases cycline-dépendantes. Afin de compléter les premiers tests biologiques sur ces indolopyrimidines, nous rapportons dans un premier temps la synthèse d'analogues NH des méridianines par deux voies : un couplage de Suzuki entre des acides indolylboroniques et une 2-amino-4-chloropyrimidine et, la formation d'un cycle 2-aminopyrimidine par condensation de la guanidine sur des ènaminones obtenues par réaction du DMF-DMA sur des 3-acétylindoles. Nous avons, dans un deuxième temps, préparé selon cette même synthèse linéaire des dérivés N-alkylés des méridianines, la formation de l'ènaminone nécessitant, cette fois, la présence de pyrrolidine. Enfin, les synthèses de divers dérivés ont été réalisées en remplaçant l'indole par le cycle 1,2,3,9-tetrahydro-4H-carbazol-4-one ou par variations autour du cycle 2-aminopyrimidine. Une partie de ces molécules a ensuite été testée, dans le cadre de la recherche contre le cancer, sur des kinases cycline-dépendantes (GSK-3 et CDK1) et sur des lignées cellulaires (RAJI, DAUDI, K562). Une série de tests a également été réalisée sur la fixation des larves de balanes afin de préciser les propriétés antifouling de ces nouvelles molécules.

Titre traduit

Meridianin analogues and derivatives : Synthesis and Structure-activity relationship study

Résumé

The marine environment constitues a very promising source for novel and bioactive molecules, and meridianins have been identified among those recently discovered. These indoles with a 2-aminopyrimidine at C-3 can inhibit cyclin-dependent kinases. In order to conduct additionnal biological tests about these 3-(2-aminopyrimidine)indoles, we first synthesised NH meridianin-analogues through two routes: (i) a Miyaura-Suzuki coupling of indol-3-ylboronic acids to 2-amino-4-chloropyrimidine, and (ii) the formation of a 2-amino-pyrimidine by guanidine condensation with enaminones issued from the reaction of N,N-dimethylformamide dimethylacetal (DMF-DMA) with 3-acetylindoles. Then, in a second stage we prepared N-alkyled derivatives of meridianins by applying the same linear synthesis, using pyrrolidine for the formation of enaminones. At last, various derivatives were prepared by replacing the indole with the 1,2,3,9-tetrahydro-4H-carbazol-4-one cycle or using various pyrimidines. Some of these molecules were finally tested against cyclin-dependent kinases (GSK-3 and CDK1) and cell lines (RAJI, DAUDI and K562) as part of cancer-related researches. Other tests about the fixation of barnacle larvae were also performed to investigate the antifouling properties of these new molecules.