Thèse soutenue

Variabilité génétique, structurale et fonctionnelle du virus de l'hépatite C
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Auteur / Autrice : Muriel Pellerin
Direction : Jean-Michel Pawlotsky
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Virologie
Date : Soutenance en 2003
Etablissement(s) : Paris 12

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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La variabilité génétique est une caractéristique essentielle des populations de virus, organisées en quasi espèces, qui leur permet d’évoluer et de s’adapter à leur environnement réplicatif, caractérisé par la modification constante des pressions de sélection qui s’exercent sur elles. Ce travail avait pour objectif de caractériser la variabilité génétique du virus de l’hépatite C (VHC) et les contraintes qui s’exercent sur elle, ainsi que de comprendre l’impact structural et fonctionnel de la distribution en quasi espèces du VHC. Pour cela, nous avons utilisé le modèle de l’administration thérapeutique d��interféron (IFN)-alpha, qui permet d’induire des modifications drastiques de l’environnement au sein duquel le virus se réplique. Dans un premier temps, nous nous sommes intéressés à la région hypervariable 1 (HVR1) de la glycoprotéine d’enveloppe E2. Nous avons développé une technique de PCR-SSCP (single-strand conformation polymorphism) et avons montré chez 114 malades infectés que la complexité génétique de cette région était plus importante chez les patients infectés par transfusion sanguine que chez les patients infectés par la toxicomanie par voie veineuse. Il n’existait pas de relation entre la complexité génétique et les paramètres virologiques de l’infection. Les marqueurs de la réponse immune et les caractéristiques clinico-biologiques de la maladie. En analyse multivariée, une faible complexité génétique était tin des facteurs prédictifs indépendants d’une réponse virologique soutenue à l’IFN-alpha en monothérapie (article 1). 70% des patients recevant de I’IFN-alpha et n’éliminant pas le VHC ont présenté des modifications importantes de la composition des quasi espèces de la région HVR1. . .