Première étude structurale et dynamique d'une peroxyrédoxine par RMN

par Xavier Trivelli

Thèse de doctorat en Chimie

Sous la direction de Jean-Marc Lancelin.

Soutenue en 2003

à Lyon 1 .

mots clés

• Peroxyrédoxine -- Structure
• Résonance magnétique nucléaire
• Stress oxydatif

Résumé

Les cellules luttent en permanence contre les pro-oxydants et leurs effets néfastes. Les hydroperoxydes en sont les plus courants. La cystéine nucléophile du site actif confère aux peroxyrédoxines (Prx) une activité peroxydasique, réductrice des hydroperoxydes dépendante notamment de thiorédoxines. Pour la première fois, une Prx, Ahp1 de Saccharomyces cerevisiae, a fait l'objet d'une étude structurale par RMN triple résonance (1H/13C/15N) sur un échantillon uniformément marqué [13C/15N/50 % 2H] en milieu aqueux réducteur. Sa topologie est semblable à celle des autres Prx. L'analyse des données de relaxation RMN 15N a émontré que Ahp1 est un homodimère 2x19,4kDa en solution, ce qui a été confirmé par ultracentrifugation analytique et par des calculs d'hydrodynamique. La forme suroxydée, préparée in vitro par un excès de tBuOOH, a été cractérisée grâce à un marquage sélectif Cys[β-13C]. Les résultats montrent que la cystéine du site actif est alors oxydée en sulfonate

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