Cartographie physique et transcriptionnelle de la region critique pour la trisomie 21 (entre d21s55-ets2)

par GHANIA AIT GHEZALA

Thèse de doctorat en Sciences médicales

Sous la direction de Pierre-Marie Sinet.

Soutenue en 2000

à Paris 7 .

mots clés

Résumé

La trisomie 21, ou syndrome de down est l'anomalie chromosomique la plus frequente, elle affecte une naissance sur 700 environ. Cette maladie est due a la presence de 3 chromosomes 21 dans la plupart des cas. Elle est caracterisee par un phenotype complexe et variable qui se traduit par des anomalies morphologiques, une hypotonie, un vieillissement accelere, une neuropathologie de type alzheimer et un retard mental constant. De rares cas de trisomie 21 partielle ont ete decrit. L'analyse de ces cas a permis de mettre en evidence une petite region du chromosome 21, en 21q2. 22 nomme dcr1, responsable de la plupart des signes de la maladie. Afin de determiner le contenu genique de cette region, nous avons entrepris la cartographie physique et transcriptionelle de la partie distale de cette region entre d21s55-erg. Une carte physique de haute resolution a ete construite a partir des yacs isoles dans la region d21s55-erg. Les yacs et les marqueurs de la region ont servi a l'isolement de 150 cosmides. La carte de restriction ecori des cosmides a permis la construction de 7 contigs de cosmides qui ont ete precisement localises sur la carte de yac. L'ensemble des cosmides couvrant 85% de la region d21s55-erg a ete utilise pour la recherche de genes par deux approches complementaire : la capture d'exons et la selection d'adnc. Nous avons ainsi identifie 9 unites de transcription (cer19. 0 a cer27. 0), dont 2 correspondent a des genes de la famille kir, et 7 nouvelles unites de transcriptions cer24. 0 est fortement exprime dans le testicule et presente un patron d'expression complexe avec des transcrits dans les deux sens.

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