Etude structurale des petites proteines g rap2a dans un complexe non catalytique avec le gtp et arf6 en complexe avec le gdp

• Auteur / Autrice : Julie Menetrey
• Direction : Jacqueline Cherfils
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques fondamentales et appliquées
• Date : Soutenance en 2000
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Les petites proteines g sont des proteines capables de fixer du gdp ou du gtp, ce qui va induire des changements de conformation au sein de la proteine qui lui permettront d'interagir avec des partenaires cellulaires distincts, et ainsi de jouer un role d'interrupteur moleculaire. Le cycle gdp/gtp des petites proteines g ne fonctionne pas seul, il est regule par un facteur d'echange gdp/gtp (gef) et une proteine activatrice de la gtpase (gap). Les petites proteines g sont impliquees dans des processus cellulaires fondamentaux et divers, comme la differentiation et la proliferation cellulaire, l'organisation et la dynamique du cytosquelette, et les transports intracellulaires. Un certain nombre de structures de petite proteine g sont maintenant connues, et ont permis de definir le repliement general des petites proteines g et les changements de conformation au cours du cycle gdp/gtp. Le premier projet porte sur l'etude structurale par diffraction des rayons x de la petite proteine g rap2a, homologue de l'oncogene ras dans un complexe non catalytique avec le gtp. Cette etude a permis de mettre en evidence la presence d'une nouvelle interaction au niveau du site nucleotidique entre la tyrosine 32 et le phosphate gamma du gtp. Et, nous avons montre que les changements de conformation de rap2a au cours de son cycle gdp/gtp sont caracterises par deux transitions desordre/ordre. Le second projet porte sur l'etude structurale par diffraction des rayons x de la petite proteine g arf6 en complexe avec du gdp. Cette etude a montre que deux proteines qui possedent une forte homologie de sequence peuvent avoir des structures assez differentes pour etre distinguees. Les principaux partenaires des formes gdp des petites proteines g sont les gef, ce qui suggere une base structurale pour la specificite des gef. En conclusion, nous discutons des bases structurales qui permettent aux petites proteines g d'etre distinguees les unes des autres.