Modélisation et simulation en mécanique moléculaire : paramétrisation des groupements nitro (conjugué) et alpha-pyrone dans le champ de force MM2, simulation d'alcoolates de terres rares à l'état amorphe

par Jean-Philippe Rameau

Thèse de doctorat en Modélisation moléculaire

Sous la direction de Jean Devillers.

Soutenue en 1997

à Toulouse 3 .

mots clés

Résumé

Sous les themes generaux de la modelisation et simulation en mecanique moleculaire, deux axes de recherche, ont ete suivis. Le premier, concerne la modelisation de molecules trypanocides. Deux series de composes les (nitro-imidazolyl)-thiadiazoles et les -pyrones ont ete etudiees. Leur modelisation par mecanique moleculaire (mm) a necessite la determination et l'affinement de certains parametres non implantes dans le champ de force mm2, le no#2 a ete inclu de maniere explicite dans le clacul de mm2 et les parametres qui en decoulent ont ete determines. Pour la parametrisation, une methode statistique de simulation parametrique basee sur l'etude de structures cristallines de molecules organiques, a ete mise en uvre. La modelisation de la serie des analogues du megazol n'a pas mis en evidence, dans les caracteristiques physicochimiques calculables, une grandeur determinante responsable de l'activite de ces composes. La raison est plus a rechercher dans la dynamique reactionnelle de ces molecules ou les presents resultats pourraient se reveler interessants. Une parametrisation similaire a la precedente a ete conduite sur les -pyrones et a permis de proposer une serie de parametres pour le carbonyle cross-conjugue et l'oxygene intracyclique. La methode developpee peut ainsi s'etendre aux lactmes, thiolactames le deuxieme axe de recherche concerne l'etude structurale de divers alcoolates metalliques, amorphes ou en solution. L'etude structurale par diffusion des rayons x aux grands angles (waxs) d'une part et l'elaboration de modeles par mecanique moleculaire d'autre part, ont ete conduits pour confronter les modeles a l'experience. Un protocole de mesure, de correction et reduction de donnees a ete mis en place pour obtenir une experience exploitable. En associant waxs a mm nous avons pu proposer les structures en solution de deux alcoolates d'erbium et d'un alcoolate amorphe de bismuth-titane

Titre traduit

Modeling and simulation in molecular mechanics: parametrisation of the conjuguated nitro group and -pyrone within the mm2 force field. Amorphous rare-earth alkoxydes simulation

Pas de résumé disponible.