Caractérisation et expression de gènes amplifiables et dispensables de streptomyces ambofaciens

par Martine Aubert

Thèse de doctorat en Génétique

Sous la direction de Bernard Decaris.

Soutenue en 1996

à Nancy 1 , en partenariat avec Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques (autre partenaire) .

mots clés

• Streptomyces ambofaciens
• Gène
• Expression génique
• Régulation
• Développement
• Différenciation
• Streptomyces ambofaciens
• Expression génique
• Gènes

Résumé

Le génome de s. Ambofaciens comporte des régions amplifiables et dispensables, notamment le locus AUD6. Deux gènes ayant 95% d'identité ont été identifiés dans les répétitions IHS et S1R* de l'AUD6. Leur transcription a été détectée chez différents mutants portant des amplifications et/ou des délétions dans l'AUD6, et ce, de manière différentielle suivant la phase de croissance. Cependant, aucune transcription n'a été détectée chez la souche sauvage. Ceci suggère que ces gènes pourraient être transcrits, mais faiblement, dans la souche sauvage. La comparaison des séquences des protéines potentielles, codées par ces gènes, avec celles des banques de données suggère que ces protéines assureraient un rôle de régulateur transcriptionnel de gènes du catabolisme. Entre IHS et S1R*, une autre séquence codante (ORFI) a été détectée, dont le produit potentiel interviendrait dans la dégradation de molécules complexes. Le produit du gène spa2, appartenant aussi à l'AUD6, présente 67% d'identité avec la protéine RspA d'e. Coli impliquée dans le contrôle de l'expression en phase stationnaire. Des mutants spécifiquement modifiés dans l'expression de spa2 ont été construits. Un mutant interrompu pour le gène spa2, par intégration de séquences phagiques, présente un phénotype mutant pour la formation du mycélium aérien et la pigmentation des colonies. D’autres caractères de la différenciation physiologique, étudiés chez ce mutant, sont semblables à ceux de la souche sauvage. Ce mutant spa2 présente une forte instabilité sur milieu solide. Le retour au phénotype sauvage s'accompagne de la perte de la construction interrompant spa2. Les colonies de la souche ayant spa2 amplifié sur un vecteur multicopie présente une importante déficience dans la formation du mycélium aérien et la pigmentation. Ainsi, spa2 prendrait part à la régulation de certains processus de la différenciation, donc dans le contrôle de gènes du développement de s. Ambofaciens

Titre traduit

Characterization and expression of amplifiable and dispensable genes of streptomyces ambofaciens

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