Contribution à l'étude taxonomique des armillaires africaines et européennes par l'analyse du polymorphisme de l'ADN ribosomal

Contribution to the taxonomy of the African and European Armillaria by analysis of ribosomal DNA

• Auteur / Autrice : Mohamed Chillali
• Direction : Bernard Botton
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées
• Date : Soutenance en 1996
• Etablissement(s) : Nancy 1
• Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques

Mots clés

Mots clés contrôlés

Classification

Champignons

Polymorphisme génétique

Afrique

Europe

Armillaria

Mots clés libres

DNA ribosomique

Réaction chaîne polymérase

Identification spécifique

Variabilité génétique

Habitat

Résumé

Le polymorphisme de l'ADN ribosomal a été étudié en vue de caractériser les espèces d'Armillaires africaines et européennes. Le polymorphisme de taille de la région ITS couplé à la RFLP a permis de caractériser les trois espèces africaines et a permis de distinguer un isolat T7 non encore identifié au niveau de son système sexuel, comme appartenant vraisemblablement à A. Hemii hétérothallique. Les techniques PCR/RFLP, en conjonction avec le séquençage de la région ITS ont permis de caractériser sept espèces européennes. D'autre part, il a été établi que A. Cepistipes est très proche de A. Gallica et que A. Borealis est proche de A. Osioyae, Une hétérogénéité a été notée à l'intérieur de A. Cepistipes qui est par conséquent composée de plusieurs types. A. Ectypa, espèce localisée uniquement dans les tourbières est clairement différente des autres espèces. L'approche moléculaire associant PCR/RFLP et au séquençage semble être un outil prometteur pour analyser et identifier dans le milieu naturel un grand nombre d'espèces.

Polymorphism of ribosomal DNA has been studied in order to characterize the African and European Armillaria species. Size polymorphism of the ITS region coupled with RFLP allowed characterising three African species, as well as the T7 isolate, which very likely belongs to the heterothallic A. Heimii species. PCR/RFLP techniques, used with sequencing of the ITS region allowed discriminating the seven European species. In addition, it has been shown that A. Cepistipes is closely related to A. Gallica and A. Borealis to A. Ostoyea. A. Cepistipes was found to be composed of several types. A. Ectypa which is exclusively found in peat bogs was clearly different from the ether species. Such molecular tools, combining PCR/RFLP and DNA sequencing appear as efficient and reliable to discriminante and identify a large number of Armillaria species in field conditions.