Differenciation genetique chez sardinolla aurita et s. Maderensis allozymes et adn mitochondrial

par Lounès Chikhi

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de François Bonhomme.

Soutenue en 1995

à Paris 6 .

mots clés

Résumé

Sardinella aurita et s. Maderensis sont deux especes de sardinelles de grande importance economique en afrique de l'ouest. La differenciation genetique de ces deux especes a ete analysee a l'aide de deux types de marqueurs genetiques. L'analyse des allozymes a mis en evidence une faible variabilite genetique chez s. Aurita et un important polymorphisme chez s. Maderensis. Cela semble du au fait que certains locus n'ont pas pu etre analyses chez s. Aurita. Chez s. Maderensis, 5 locus variables ont permis de mettre en evidence une legere differenciation en afrique de l'ouest ainsi que de tres forts deficits en heterozygotes. Ces deficits semblent decroitre avec l'age des individus. En outre des bancs de jeunes individus presentent egalement de tres forts deficits en heterozygotes sans etre differencies les uns des autres, ce qui montre que ces deficits ne sont pas dus a des melanges d'unites de reproduction mais a des phenomenes internes aux bancs. La region de controle de l'adn mitochondrial a ete amplifiee par reaction de polymerisation en chaine et digeree par des enzymes de restriction. Chez s. Aurita les resultats montrent que les regions mediterraneennes et africaines sont genetiquement tres differenciees et que les echantillons americains sont genetiquement tres proches des echantillons mediterraneens bien que la differenciation entre ces deux regions soit significative. Ceci nous a permis de proposer un scenario de colonisation impliquant une fondation des populations americanes et mediterraneennes, peu variables, a partir des populations africaines. Par ailleurs, aucune differenciation nette n'a ete mise en evidence le long des cotes africaines. Les resultats du test de tajima et l'analyse des distributions des differences par paires pourraient indiquer un evenement recent d'expansion rapide sur l'aire de distribution africaine actuelle. Chez s. Maderensis, l'analyse de la region de controle a permis de montrer qu'il existe une differenciation en afrique de l'ouest, principalement due a la presence de l'echantillon des canaries. S. Maderensis egalement influencee par un evenement demographique recent

Titre traduit

Genetic differentiation of sardinella aurita and s. Maderensis, allozymes and mitochondrial dna

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