Filtrage d'ordre directionnel adaptatif : application aux autoradiographies de séquences d'A. D. N.

par Jean-Louis Vila

Thèse de doctorat en Électronique, électrotechnique, automatique

Sous la direction de Philippe Bolon.

Soutenue en 1995

à Chambéry , en partenariat avec Laboratoire d'automatique et de microinformatique industrielle (Annecy) (laboratoire) .

mots clés

• Filtres adaptatifs
• Autoradiographie
• Traitement d'images -- Techniques numériques
• Séquençage des acides nucléiques

Résumé

Dans la présente étude, on propose un filtre d'ordre directionnel adaptatif basé sur un partitionnement de la fenêtre d'analyse en segments de droite discrets. Il permet la conservation de structures fines et allongées et une bonne réduction du bruit. L'estimation de direction est obtenue à partir d'un critère d'homogénéité. En fonction de l'anisotropie locale, le filtrage est effectué soit dans une fenêtre mono-dimensionnelle directionnelle (anisotropie forte), soit dans la fenêtre bi-dimensionnelle (anisotropie faible). On caractérise les performances en réduction de bruit et l'estimation d'orientation locale pour différents critères d'homogénéité. Ces études donnent des éléments pour le choix du critère d'homogénéité en fonction des caractéristiques géométriques et statistiques de l'image traitée. A partir de ces résultats généraux, l'opérateur directionnel a été inséré dans une chaîne de lecture automatique d'autoradiographies de séquences d'ADN. Les résultats obtenus mettent en évidence l'efficacité du filtre d'ordre directionnel. Enfin, le filtre d'ordre directionnel adaptatif a été testé dans le cadre plus vaste des images naturelles d'origines diverses (aériennes, médicales…)

Titre traduit

Directional adaptive order filtering: application to DNA sequence analysis

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