Thèse de doctorat en Biologie cellulaire. Microbiologie
Sous la direction de Jean-Louis Garcia.
Soutenue en 1995
à Aix-Marseille 1 .
Cette these a porte sur l'etude de certains ecosystemes hypersales africains et de certains puits de petrole presentant des salinites ou des temperatures elevees. Nos travaux ont permis d'isoler plusieurs nouvelles especes et un nouveau genre de bacteries fermentaires anaerobies strictes halophiles appartenant a la famille des haloanaerobiaceae. Deux souches methanogenes ont ete isolees d'une eau de gisement petrolier. La souche fr1t, bacterie halophile methylotrophe similaire a methanohalophilus mahii et la souche fr1f qui oxyde l'hydrogene dans les conditions de salinite les plus elevees que l'on connaisse (12%) et qui devrait definir un nouveau genre. Le premier transfert interespeces d'hydrogene sur glycerol entre des souches fermentaires et une bacterie sulfatoreductrice hydrogenotrophe a ete demontre dans les milieux contenant de fortes teneurs en nacl. Les processus de mineralisation de la matiere organique ont de ce fait, ete mieux compris. Des etudes physiologiques effectuees sur halothermothrix orenii et les deux souches methanogenes frit et fr1h ont permis de montrer que la glycine betaine intervenait comme osmoregulateur chez ces microorganismes. Cette molecule n'avait jamais ete observee chez les haloanaerobiaceae dont fait partie halothermothrix orenii. Les etudes effectuees sur une eau de gisement petrolier a haute temperature ont permis d'isoler une bacterie fermentaire appartenant au genre thermoanaerobacter (souche fr2) proche de t. Finnii. L'oxydation de l'hydrogene en presence de thiosulfate a ete demontree pour la premiere fois chez toutes les especes de ce genre. La decouverte de populations thiosulfato-reductrices non sulfato-reductrices remet en cause l'hypothese selon laquelle les bacteries sulfato-reductrices seraient les seuls intervenants dans les processus de corrosion bacterienne
Study of strict anaerobic bacteria isolated from hypersaline or thermophilic extreme environments
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