Etudes structurales des épitopes protéiques : prédiction d'épitope et mesure d'affinité d'anticorps monoclonaux anti-viraux

Structural study of protein epitopes : antigenicity predictors and affinity measurement of anti-viral monoclonal antibodies

• Auteur / Autrice : Jean-Luc Pellequer
• Direction : Marc H. V. Van Regenmortel, Eric Westhof
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie moléculaire
• Date : Soutenance en 1993
• Etablissement(s) : Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)

Résumé

Le travail décrit dans ce mémoire concerne d'une part, la mise au point d'une technique de prédiction de sites antigéniques (épitopes), et d'autre part la mesure de la force avec laquelle un anticorps se lie à son antigène. La méthode de prédiction d'épitope est basée sur la localisation des tournants dans les protéines. Le motif structural tournant répond, a lui seul, a presque tous les critères qui caractérisent les épitopes qui sont: l'hydrophile, l'accessibilité et la flexibilité. L'utilisation de cette nouvelle méthode a permis d'obtenir une fiabilité de prédiction voisine de 70% avec seulement deux ou trois pics par profil. Les mesures de constantes d'affinité (k) ont été réalisées à l'aide de trois techniques différentes basées sur le test Élisa. Les mesures de constantes cinétiques ont été effectuées grâce à la technologie des biocapteurs et de l'instrument biacore. La comparaison des trois techniques a l'équilibre a permis de confirmer l'importance de l'aspect opérationnel des mesures de constante d'affinité en montrant que: la valeur de k varie de manière inversement proportionnelle à la concentration en anticorps, de la nature bivalente ou monovalente de la fixation des anticorps et du type de test employé. L'utilisation de la technologie des biocapteurs a montré que c'est la constante cinétique d'association qui est principalement responsable de la dépendance de k vis-à-vis de la concentration