Plasticité génomique chez streptomyces ambofaciens dsm40697 : analyses structurale et transcriptionnelle d'un point chaud de délétion

par Dominique Schneider

Thèse de doctorat en Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie

Sous la direction de Bernard Decaris.

Soutenue en 1993

à Nancy 1 , en partenariat avec Université Henri Poincaré Nancy 1. Faculté des sciences et techniques (autre partenaire) .

mots clés

• Réarrangement génique
• Recombinaison
• Réplication
• Terminaison réplication
• Analyse structurale
• Instabilité
• Streptomyces ambofaciens
• Locus aud6
• Gene rearrangement
• Recombination
• Replication
• Replication termination
• Structural analysis
• Instability
• Réarrangement génétique
• Recombinaison génétique
• Streptomyces ambofaciens

Résumé

L'étude a porté sur le locus amplifiable et délectable aud6 de l'eubactérie streptomyces ambofaciens. Ce locus est conservé dans les différentes souches sauvages. L'analyse d'une partie de ce locus a révélé la présence de deux gènes transcrits, appelés spar et spa2. Leur région régulatrice présente des promoteurs divergents. Le gène spar est surtranscrit à l'état amplifié, contrairement au gène spa2 qui est alors réprimé. Ces résultats infirment l'hypothèse selon laquelle la région instable est vide de gènes. Une forte fréquence d'amplifications et d'extrémités de délétion est observée à l'intérieur de l'aud6. Ce locus est donc un point chaud de réarrangements. Des événements successifs sont également détectés. Ce locus aud6 pourrait ainsi être impliqué, au niveau structural et/ou fonctionnel, dans le mécanisme de l'instabilité génomique. Ces résultats permettent de postuler que ce locus contiendrait un site terminus de la réplication

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