Caractérisation et diversité des souches de Rhizobium nodulant le haricot (Phaseolus vulgaris L. ) cultivé en 3 sites tropicaux

par Aris Tjahjoleksono

Thèse de doctorat en Sciences. Microbiologie

Sous la direction de Noëlle Amarger.

Soutenue en 1993

à Lyon 1 .

Le jury était composé de Noëlle Amarger.

mots clés

• Rhizobium
• Plasmides
• Haricot commun
• Nodosités (botanique)
• Plantes fixatrices d'azote
• Variabilité génétique

Résumé

Afin de determiner quels etaient en conditions naturelles de culture les genotypes bacteriens a l'origine des nodosites formees sur le haricot, trois populations naturelles ont fait l'objet d'une etude de caracterisation et de diversite. Ces 3 populations sont constituees des isolats echantillonnes a partir de nodosites de haricot cultive en 3 sites dans des regions tropicales: 2 sites en indonesie et 1 au burundi. Parmi les isolats nodulants, 2 isolats du burundi presentent les caracteristiques de r. Tropici. Les isolats restants presentent les caracteristiques de r. Leguminosarum bv. Phaseoli et r. Etli bv. Phaseoli. L'analyse des profils plasmidiques a montre qu'il etait possible de regrouper les isolats selon deux niveaux de similarite, l'un pour lequel les profils etaient identiques l'autre pour lequel une partie du profil etait commune. Aucun profil commun n'a ete observe entre les isolats de l'indonesie et du burundi. Apres extraction et digestion de l'adn total par des enzymes de restriction, l'analyse du polymorphisme de longueur des fragments de restriction hybridant avec 3 sondes chromosomiques et 2 sondes du plasmide symbiotique a ete realisee sur les 85 isolats selectionnes. Cette analyse a permis de differencier 4 grands groupes chromosomiques, eux memes plus ou moins diversifies et 2 groupes de plasmide symbiotique repartis parmi les groupes chromosomiques. Certains genotypes chromosomiques et symbiotiques etaient conserves parmi les isolats des 3 sites representant 2 continents

Titre traduit

Characterization and diversity of rhizobium strains nodulating beans (phaseolus vulgaris l) grown in 3 tropical sites

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