Caractérisation de gènes dont l'expression est régulée par le pH extracellulaire chez Escherichia coli K-12 et analyse des éléments intervenant en cis ou en trans dans ce contrôle

Identification and characterization of ph-regulated genes in escherichia coli k-12 and analysis of the regulatory mechanisms involved in this control

• Auteur / Autrice : Jean-Luc Coll
• Direction : Raymond Portalier
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences. Génétique
• Date : Soutenance en 1992
• Etablissement(s) : Lyon 1
• Jury : Président / Présidente : Raymond Portalier

Mots clés

Mots clés contrôlés

Fusion de gènes

Régulation génétique

Escherichia coli

Résumé

Le programme d'identification et de caracterisation des genes dont l'expression est regulee par le ph extracellulaire (phe) chez escherichia coli, a ete initie alors que seulement trois genes ph-regules avaient ete decrits, et que les mecanismes de leur regulation etaient inconnus. Afin d'identifier de nouveaux genes ph-regules, nous avons construit des souches bacteriennes portant des fusions dans des genes dont l'expression est sensible au phe (notes phm pour ph-modulated). Dans un premier temps, nous avons caracterise genetiquement in vivo les genes phm. Les resultats obtenus montrent qu'ils sont localises dans 6 nouveaux loci phma, b, c, d, e, f, ainsi que dans la region ma1b qui code pour les transporteurs du maltose. Dans un second temps, nous avons etudie les mecanismes de la ph-regulation des genes phma et ma1e. Dans ce but, nous avons clone et sequence les 2 fusions de genes correspondantes. D'une part, nous avons montre que le gene phma est identique au gene nmpc qui code pour une porine de la membrane externe. D'autre part, nous avons caracterise precisement le site d'insertion de la fusion dans le gene ma1e. L'isolement et l'utilisation de deletions d'etendue variee dans le promoteur du gene nmpc nous ont permis de montrer que la ph-regulation de ce gene est liee a l'action antagoniste du complexe cap-ampc et d'un represseur encore inconnu. Par ailleurs, l'obtention de mutants de la ph-regulation nous a conduit a caracteriser une mutation dans le gene ptsg, gene de la permease du glucose, qui peut, dans certains cas, annuler la ph-regulation du gene ma1e