Contribution à l'étude de l'organisation et de l'expression du génome du virus des taches foliaires chlorotiques du pommier, ACLSV

Genomic organization of apple chlorotic leaf spot closterovirus

• Auteur / Autrice : Sylvie German-Retana
• Direction : Joseph Marie Bové
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la vie
• Date : Soutenance en 1991
• Etablissement(s) : Bordeaux 2

Résumé

Le virus des taches foliaires chlorotiques du pommier (apple chlorotic leaf spot virus ou aclsv) est classe parmi les closterovirus. Ce virus infecte la plupart des espèces fruitières et ornementales de la famille des rosacées. Le génome viral constitue d'un ARN monocaténaire polyadenyle de 7555 nucléotides a été cloné et séquencé. Trois cadres ouverts de lecture chevauchants codent respectivement pour des protéines de 216 KDA (ORF 1), 50 KDA (ORF 2) ET 28 KDA (ORF 3). L’analyse par northern blotting des ARN bicatenaires montre qu'en plus des formes bicatenaires du génome viral et de deux ARN subgénomiques pour les ORF 2 et 3, trois autres espèces d’ARN bicentenaires sont détectées. Deux d'entre elles sont 5 co-terminales avec l’ARN génomique. Un modelé de production des ARN bicentenaires a été propose. D’après des homologies de séquences avec des protéines virales de fonction connue, la protéine de 50 KDA serait la protéine de transport de l' ACLSV. La protéine de 216 KDA contient deux motifs de séquence conserves parmi les protéines virales associées a la réplication. Sur la base de ces séquences, l'ACLSV est classe dans le super groupe des virus alpha-associes au coté des potex-, carla- et tymovirus. La protéine de capside de 22 KDA peut être produite par initiation interne au niveau du second codon d'initiation de l'ORF 3. Cette protéine ne montre aucune homologie de séquences avec la protéine de capside du BYV (membre type des closterovirus). Ces résultats joints à la différence dans l'organisation de la région 3 du génome de l' ACLSV et du BYV et aux différences biologiques existantes entre ces deux virus, nous conduisent à envisager la classification de l'aclsv dans un nouveau groupe de virus