Assemblage et topologie d'une protéine majeure de l'enveloppe d'Escherichia coli : OmpF

Assembly and topology of a major envelope protein of Escherichia coli: OmpF

• Auteur / Autrice : Jean-Michel Bolla
• Direction : Claude Lazdunski
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie cellulaire et microbiologie
• Date : Soutenance en 1990
• Etablissement(s) : Aix-Marseille 2
• Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université d'Aix-Marseille II. Faculté des sciences (1969-2011)

Résumé

L'organisation sub-cellulaire des bacteries gram negatifs est definie par quatre compartiments: le cytoplasme, la membrane interne ou cytoplasmique, le periplasme et la membrane externe. Chaque compartiment contient des proteines dont la conformation, la topologie et la fonction sont parfaitement definies. Or, toutes les proteines sont synthetisees dans le cytoplasme, elles doivent donc posseder des informations structurales et/ou conformationnelles qui permettent a la machinerie cellulaire de les acheminer vers leur compartiment fonctionnel. Nous avons analyse l'assemblage et la topologie de ompf, une proteine majeure de la membrane externe d'escherichia coli. Elles est organisee sous forme trimere fortement associee au lipopolysaccharide, permet la diffusion de solutes de petit poids moleculaire et presente une fonction recepteur pour certains phages et certaines colicines. Au cours de la biosynthese et de l'assemblage, quatre formes differentes de la molecule ont ete caracterisees: la forme precurseur clivee en forme monomere qui tres rapidement donne naissance a une forme trimere metastable; un changement de conformation donne naissance au trimere natif. La trimerisation doit se produire rapidement apres le clivage du peptide signal et en presence de synthese lipidique; si les deux processus sont decouples, le monomere evolue vers une conformation inadequate pour l'integration dans la membrane. Par ailleurs, la region c-terminale est necessaire a la proteine afin d'assurer la stabilite de son assemblage. En etudiant plusieurs proteines hybrides, nous avons defini les regions exposees de la molecule intervenant dans le site recepteur des colicines a et n. Ainsi, nous avons apprehende la topologie d'une proteine multimerique dans une membrane bacterienne et etabli des relations entre la structure, l'assemblage et les fonctions d'une telle molecule