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Éric Bapteste a rédigé les 2 thèses suivantes :

Au delà de l'Arbre du vivant : pour une phylogénie postmoderne

par Éric Bapteste sous la direction de Jean Gayon - Paris 1

Philosophie

Soutenue en 2007

Phylogénie générale des Eucaryotes basée sur l'analyse de multiples marqueurs

par Éric Bapteste sous la direction de Hervé Philippe - Paris 6

Biologie

Soutenue en 2003

Éric Bapteste a dirigé les 7 thèses suivantes :

Réseaux de communication au sein de communautés microbiennes environnementales

par Charles Bernard sous la direction de Philippe Lopez , Éric Bapteste et de Yanyan Li . - Sorbonne université

Bioinformatique évolutive

Soutenue le 20-01-2022

Recherche de séquences environnementales inconnues d’intérêt médical/biologique par l’utilisation de grands réseaux de similarité de séquences

par Romain Lannes sous la direction de Éric Bapteste et de Philippe Lopez . - Sorbonne université

Biologie évolutive

Soutenue le 19-11-2019

Etude de l'impact d'un changement de régime alimentaire sur le microbiome intestinal de Podarcis sicula

par Chloé Vigliotti sous la direction de Éric Bapteste , Anthony Herrel et de Philippe Lopez . - Paris, Muséum national d'histoire naturelle

Sciences de la vie et de la santé

Soutenue le 20-11-2017

Study of modularity in molecular, morphological and linguistic evolution using networks methods

par Jananan Pathmanathan sous la direction de Éric Bapteste et de Philippe Lopez . - Paris 6

Biologie évolutive

Soutenue le 23-10-2017

Étude des processus introgressifs en évolution par des méthodes de réseaux

par Raphaël Méheust sous la direction de Éric Bapteste et de Philippe Lopez . - Paris 6

Biologie Evolutive

Soutenue le 09-12-2016

Étude de l'évolution combinatoire des gènes par l'analyse de réseaux de similarité de séquence

par Pierre-Alain Jachiet sous la direction de Éric Bapteste et de Philippe Lopez . - Paris 6

Biologie évolutive

Soutenue le 02-07-2014

Métagénomique intégrative : étude de la diversité génétique par des méthodes de réseaux de similarité de séquence et application au microbiome intestinal humain

par Cédric Bicep sous la direction de Éric Bapteste et de Philippe Lopez . - Paris 6

Biologie Evolutive

Soutenue en 2013

Éric Bapteste a été rapporteur des 2 thèses suivantes :

Une approche éco-évolutive de la propagation de la résistance antibiotique : l'exemple de la résistance aux aminoglycosides

par Léa Pradier sous la direction de Stéphanie Bédhomme - Université de Montpellier (2022-....)

Sciences de l'évolution et de la Biodiversité

Soutenue le 12-04-2022

Discrimination analytique des génomes bactériens

par Olivier Poirion sous la direction de Laurent Krähenbühl et de Bénédicte Lafay . - Ecully, Ecole centrale de Lyon

Ingéniérie pour le vivant

Soutenue le 28-11-2014

Éric Bapteste a été membre de jury des 2 thèses suivantes :

Étude du pangénome d’une population bactérienne structurée : vers une nouvelle compréhension de l’origine des variations intra-génomiques

par Hélène Gardon sous la direction de Corinne Petit-Biderre et de Gisèle Bronner . - Université Clermont Auvergne (2021-...)

Bioinformatique

Soutenue le 03-12-2021

La relation symbiotique

par Sonia Harzallah Debbabi sous la direction de Thierry Hoquet - Lyon

Philosophie - Etude des systèmes

Soutenue le 15-06-2018