Dynamique structurelle des biofilms exposés à des métaux et effets sur les fonctions des rivières.

Structural dynamics of biofilms exposed to metals and effects on river functions.

• Auteur / Autrice : Sarah Gourgues
• Direction : Severine Le faucheur, Maria soledad Goni urriza
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Aspects moléculaires
• Date : Inscription en doctorat le 29/08/2021
• Etablissement(s) : Pau
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale sciences exactes et leurs applications (Pau, Pyrénées Atlantiques ; 1995-)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut des sciences analytiques et de Physico-chimie pour l'Environnement et les Matériaux

Mots clés

Mots clés libres

Microbiologie

Génomique environnementale

Écotoxicologie

Limnologie

Biologie moléculaire

Molecular Biology

Environmental genomics

Ecotoxicology

Limnology

MIcrobiology

Résumé

Les biofilms sont des communautés de microorganismes (bactéries, algues, champignons, méiofaune) vivant sur des substrats immergés dans les écosystèmes aquatiques. Ces communautés ont la particularité intéressante de réagir rapidement et de manière sensible aux changements de la qualité de l'eau, notamment à la présence de métaux. L'exposition aux métaux peut avoir des effets négatifs sur les biofilms à tous les niveaux de l'organisation biologique. Les conséquences de tels impacts pourraient avoir des répercussions sur les fonctions des rivières puisque les biofilms sont impliqués dans les cycles biogéochimiques des éléments majeurs (C, N, S, O) et des traces (métaux), alors qu'ils font partie du premier maillon de la chaîne alimentaire. Ce projet doctoral vise à étudier le lien entre la composition des biofilms et les fonctions des rivières afin d'évaluer quels indicateurs génomiques basés sur les biofilms sont les meilleurs pour évaluer la santé des rivières.

Biofilms are communities of microorganisms (bacteria, algae, fungi, meiofauna) living on submerged substrates in aquatic ecosystems. These communities have the interesting feature of responding quickly and in a sensitive manner to changes in water quality, especially the presence of metals. Exposure to metals can have negative effects on biofilms at all levels of the biological organization. The consequences of such impacts could have repercussions on the functions of rivers since biofilms are involved in the biogeochemical cycles of major elements (C, N, S, O) and traces (metals), while they are part of the first link of the food chain. This doctoral project aims to study the link between the composition of biofilms and the functions of rivers to evaluate which genomic biofilm-based indicators are the best to assess river health.