Tests sensibles exploitant la reconnaissance de peptides et aptamères pour une détection sur site de cellules et spores bactériens dans le lait et la viande

Sensitive peptide- and apta-assays for on-site detection of bacterial cells and spores in milk and meat samples

• Auteur / Autrice : Francesco Rizzotto
• Direction : Jasmina Vidic
• Type : Projet de thèse
• Discipline(s) : Biotechnologies
• Date : Inscription en doctorat le 01/10/2021
• Etablissement(s) : université Paris-Saclay
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Agriculture, Alimentation, Biologie, Environnement, Santé
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : MICALIS- Microbiologie de l'Alimentation au service de la santé humaine
• Partenaire(s) de recherche : référent : AgroParisTech (France ; 2007-....)

Mots clés

Mots clés libres

Campylobacter

Securité des aliments

Bacillus cereus

Spores

Biocapteurs

Aptamers

Campylobacter

Food safety

Bacillus cereus

Spores

Biosensors

Aptamers

Résumé

L'intoxication alimentaire est la première cause mondiale d'hospitalisation. Les méthodes actuelles de diagnostic des agents pathogènes sont soit lentes et coûteuses, soit techniquement complexes car nécessitant du matériel génétique isolé. Les biocapteurs exploitent la spécificité et la sensibilité des systèmes biologiques dans de petits dispositifs peu coûteux, offrant une alternative robuste aux méthodes conventionnelles. Nous proposons une recherche innovante et ambitieuse pour fournir un capteur électrochimique économique basé sur des peptides et aptamères connectés à une instrumentation portable pour l'analyse des aliments sur site. Le dispositif permettra la détection quantitative d'agents pathogènes hautement pertinents tels que Campylobacter (viande de volaille) et Bacillus cereus (lait). Finalement, le capteur sera optimisé pour dépister les spores de B. cereus dans les lactariums. Ce type de test portable n'existe actuellement pas dans l'UE pour le criblage alimentaire.

Food poisoning is the first cause of hospitalization over the world. Current diagnostics for foodborne pathogens are expensive, time-consuming or need isolated genetic materials and sophisticated instruments. Electrochemical biosensors harness the specificity and sensitivity of biological systems in small, low cost devices providing a powerful alternative to conventional methods. We propose an innovative and ambitious research to provide a low-cost electrochemical sensor based on small peptides and aptamers connected to a portable instrumentation for on-site food analysis. The project device will enable quantitative detection of highly relevant foodborne pathogens Campylobacter (in poultry meat) and Bacillus cereus (in milk). In addition, the sensor will be optimised for control of human milk banks for the presence of B. cereus spores. Currently there is no such portable test for pathogen diagnostics in food samples in EU.