Recrutement instructif du complexe Polycomb sur les Elements Transposables chez Arabidopsis thaliana
Auteur / Autrice : | Tamara Yehouessi |
Direction : | Angélique Deleris |
Type : | Projet de thèse |
Discipline(s) : | Génétique |
Date : | Soutenance en 2023 |
Etablissement(s) : | université Paris-Saclay |
Ecole(s) doctorale(s) : | École doctorale Sciences du Végétal : du gène à l'écosystème |
Partenaire(s) de recherche : | Laboratoire : I2BC - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule |
Equipe de recherche : Régulation épigénétique des éléments transposables chez Arabidopsis | |
référent : Faculté des sciences d'Orsay | |
graduate school : Université Paris-Saclay. Graduate School Biosphera (2020-....) | |
Jury : | Président / Présidente : Dao-Xiu Zhou |
Examinateurs / Examinatrices : Elena Caro, Marie Mirouze, Filipe Borges, Angélique Deleris | |
Rapporteurs / Rapporteuses : Elena Caro, Marie Mirouze |
Mots clés
Résumé
Les éléments transposables (ETs) sont des séquences d'ADN répétées qui peuvent potentiellement se déplacer et se multiplier dans le génome. La transposition peut être délétère et de fait, est contrôlée négativement par le génome hôte. Chez Arabidopsis thaliana, la méthylation de l'ADN est une marque de répression épigénétique stable des ETs. L'autre marque épigénétique majeure de répression est la déposition par les protéines du groupe Polycomb (PcG) de la triméthylation de la Lysine 27 de l'histone 3 (H3K27me3) qui cible principalement les gènes du développement. Par conséquent, la méthylation de l'ADN et H3K27me3 ont longtemps été considérées comme exclusives des TE et des gènes respectivement. Cependant, des exemples récents montrent que certains ETs sont marqués par H3K27me3, soit en l'absence de méthylation de l'ADN, soit en cooccurrence avec la méthylation de l'ADN. De manière plus frappante, nous avons récemment découvert qu'une fraction significative des ETs est marquée par H3K27me3, et non pas par la methylation de l'ADN dans des conditions épigénétiques sauvages. Pour comprendre les implications de la déposition de H3K27me3 au niveau des ETs sauvages, nous avons mené une approche transgénique pour modéliser l'insertion de novo d'ETs, et nous montrons que les ETs peuvent recruter H3K27me3 de manière instructive, intrinsèquement à leur séquence et indépendamment de la localisation de leur insertion. Par la suite, nous discutons des déterminants moléculaires potentiels du complexe répressif Polycomb 2 (PRC2) au niveau de ces TE cibles H3K27me3. Il a été démontré que les Polycomb Responsive Elments (PRE) et leurs facteurs de transcription apparentés (FTs) ainsi que les longs ARNs non codants sont impliqués en tant que déterminants moléculaires des protéines PcG attachées aux gènes et restent des acteurs plausibles pour l'attachement aux TE. Ensemble, ces résultats dévoilent un nouveau paradigme dans le mécanisme d'inactivation des TE chez Arabidopsis thaliana et font partie d'une étude plus globale sur le rôle du dépôt de protéines PcG au niveau des ETs dans leur contrôle.