Rôle de séquences régulatrices dans la régulation de l'expression génique chez Escherichia coli

par Fan Chen

Projet de thèse en Ingénieries microbienne et enzymatique

Sous la direction de Laurence Girbal et de Sébastien Nouaille.

Thèses en préparation à Toulouse, INSA , dans le cadre de École doctorale Sciences écologiques, vétérinaires, agronomiques et bioingénieries , en partenariat avec TBI - Toulouse Biotechnology Institute, Bio & Chemical Engineering (laboratoire) et de BLADE - Adaptation, diversité et ingénierie des bactéries (equipe de recherche) depuis le 01-11-2018 .


  • Résumé

    L'objectif de la thèse est d'étudier les régulations post-transcriptionnelles chez E. coli et en particulier les régulations de la dégradation des ARNm. Les questions scientifiques du projet sont: Quels sont les mécanismes qui contrôlent l'expression des protéines et la stabilité des ARNm? Quels sont les déterminants de ces mécanismes? Les déterminants identifiés pourront-ils être des leviers originaux pour optimiser l'expression génétique chez E. coli?

  • Titre traduit

    Role of regulatory sequences in regulating Escherichia coli gene expression


  • Résumé

    In the fields of health and biotechnology, understanding the regulation of gene expression is crucial to control the functioning of bacteria and optimize their industrial performance. The control of gene expression in the bacterium Escherichia coli encompasses post-transcriptional regulation and particularly the regulation of mRNA degradation, which is largely unknown to date. The scientific questions of this PhD project are: What are the mechanisms controlling protein expression and mRNA stability in bacteria? What are their determinants and can they be original levers for gene expression optimization. Three complementary aspects will be developed: 1) Construction and expression of a library of native regulatory sequences fused to a reporting protein and classification by protein level and mRNA stability; 2) Investigation of the key determinants (sequences, structures) of expression level and mRNA stability and 3) Molecular validation of the most promising determinants and utilization for expressing genes of interest. This work will reinforce the basic knowledge on gene expression regulation and mRNA stability control. The best sequences will constitute new molecular bio-bricks useful in synthetic biology to improve and control the production of proteins of medical interest.