Analyses bioinformatiques et biologie des systèmes des relations entre les cellules cancéreuses et le microenvironnement dans les métastases hépatiques du cancer colorectal et les tumeurs pancréatiques

par Guillaume Tosato

Projet de thèse en Biologie Santé

Sous la direction de Jacques Colinge et de Andrei Turtoi.

Thèses en préparation à Montpellier , dans le cadre de Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé , en partenariat avec IRCM - Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (laboratoire) et de Bioinformatique et biologie des systèmes du cancer. (equipe de recherche) depuis le 01-10-2018 .


  • Résumé

    Analyses computationnelles de données multiomiques dont des données de transcriptomique, de protéomique et de métabolomique afin de caractériser l'hétérogénéité spatiale de tissus de métastases hépatiques obtenus par résection sur des patients atteints de cancer colorectal, ainsi que la communication entre cellules cancéreuses et fibroblastes associés au cancer (CAF) induits. Cette communication étendue entre cellules cancéreuses et le stroma en général sera étudiée sur des échantillons de ponction de biopsie pancréatique de patients dont un cancer pancréatique est suspecté.

  • Titre traduit

    Bioinformatics and systems biology analysis of the relationships between cancer cells and the microenvironment in colorectal cancer liver metastases and pancreatic tumors


  • Résumé

    Computational analysis on multiomics data comprised of transcriptomics, proteomics and metabolomics data to study -among other things- spatial heterogeneity of colorectal cancer (CRC) liver metastases resected on CRC patients and in-vitro communication occured between cancer cells and cancer-associated fibroblasts (CAF) induced. Moreover, communication between cancer cells and stroma (not only CAF) will be studied on suspected pancreatic cancer patients thanks to needle biopsy material.