Étude de l'histoire évolutive d'une espèce d'insecte d'intérêt agronomique et application en sélection.

par Joseph Guilliet

Projet de thèse en Biotechnologies

Sous la direction de Jonathan FilÉe.

Thèses en préparation à Paris Saclay , dans le cadre de École doctorale Structure et Dynamique des Systèmes Vivants (Gif-sur-Yvette, Essonne ; 2015-....) , en partenariat avec Évolution, Génomes, Comportement et Écologie (laboratoire) et de Université Paris-Sud (établissement de préparation de la thèse) depuis le 01-01-2019 .


  • Résumé

    La problématique générale est d'améliorer les connaissances génétiques fondamentales disponibles sur Hermetia. Cette thèse inclut plusieurs travaux comme le séquençage et l'annotation d'un génome de référence de grande qualité, la caractérisation de souche d'origines diverses et la mise en place d'outil de génomique pouvant par la suite être utilisés dans des programmes de sélection. Le projet inclus une phase de collecte d'échantillons sur le terrain en mobilisant notamment les réseaux de collaboration de chaque partie. A court terme, l'objectif est de mieux comprendre l'histoire évolutive de l'espèce afin de caractériser la dynamique et le tempo de l'invasion. A plus long terme, en procurant une base de connaissance génétique de l'espèce, les résultats attendus après cette thèse sont de pouvoir développer des schémas et des méthodes de sélection à l'échelle de l'individu et non des populations (comme dans le cas d'un schéma de sélection massale déjà mis en place par CYCLE FARMS).

  • Titre traduit

    Study of evolutionary history of an insect of agronomic interest and selection application


  • Résumé

    The main problematic is to improve the fundamental genetic knowledge available on Hermetia. This thesis includes several works such as the sequencing and annotation of a high quality reference genome, strain characterization of various origins and the implementation of a genomic tool that can subsequently be used in breeding selection programs. The project includes a phase of collecting samples in the field by mobilizing in particular the networks of collaboration of each part. In the short term, the goal is to better understand the evolutionary history of the species in order to characterize the dynamics and tempo of the invasion. In the longer term, by providing a basis for genetic knowledge of the species, the results expected after this thesis are to be able to develop schemes and methods of selection at the individual level and not populations (as in the case of a mass selection scheme already implemented by CYCLE FARMS)