MIME Modélisation Intéractive globale d'un système de production de micro-organismes

par Thomas Chabin

Projet de thèse en Mathématiques appliquées

Sous la direction de Nathalie Perrot, Evelyne Lutton et de Fernanda Fonseca.

Thèses en préparation à Paris, Institut agronomique, vétérinaire et forestier de France , dans le cadre de École doctorale Agriculture, Alimentation, Biologie, Environnement, Santé (Paris ; 2015-....) , en partenariat avec GMPA - Génie et Microbiologie des Procédés Alimentaires - UMR INRA/AgroparisTech (laboratoire) depuis le 01-09-2015 .


  • Résumé

    L'ambition de ce projet de thèse est de développer une approche de modélisation des dynamiques multi-échelles d'un processus de production de bactéries lactiques stabilisées (ferments pour l'industrie alimentaire). Pour comprendre et maîtriser ce processus, nous proposons d'intégrer l'ensemble des connaissances capitalisées aux différentes échelles. Les données disponibles ont été recueillies aux échelles moléculaires, de la population bactérienne, du procédé et du système de production dans son ensemble. Au-delà des données expérimentales, nous nous appuierons fortement sur la connaissance recueillie auprès des experts, une première force de l'équipe encadrante. Une originalité supplémentaire réside dans le développement d'une méthode interactive (avec l'expert) de modélisation couplant représentations sous forme de graphes, exploration visuelle par algorithme évolutionnaire et apprentissage automatique.

  • Titre traduit

    MIME : Global Interactive Modelisation of a Micro-organisms production system


  • Résumé

    This PhD project is focused on the methodology's development of the modelisation of multiscale dynamics involved in a production process of stabilized lactic acid bacteria (starters for food industry). To improve the understanding and the control of such process, . we will integrate available knowledge at the various scales into a global model. The scales will correspond to data collected at molecular scale, population scale, process scale and systems scale. Beyond experimental data, we will integrate expertise, a strength of the team. The originality of this project relies on an interactive tool coupling graph knowledge representations, interactive evolutionary visualisation and interaction with the expert.