Quantification de l'allocation des ressources bactériennes lors des changements d'environnement au niveau des cellules individuelles.

par Antrea Pavlou

Projet de thèse en Virologie - Microbiologie - Immunologie


Sous la direction de Hans Geiselmann et de Hidde De jong.

Thèses en préparation à l'Université Grenoble Alpes , dans le cadre de École doctorale chimie et science du vivant , en partenariat avec Laboratoire Interdisciplinaire de Physique (laboratoire) et de BIOP : Biophysique : fluctuations, régulations et évolution des systèmes vivants (equipe de recherche) depuis le 01-11-2018 .


  • Résumé

    La relation entre la croissance bactérienne et l'environnent est étudiée extensivement pendant les 50 dernières années. Pendant tous ce travaux, les bactéries ne sortent jamais de l' état stationnaire de croissance, cependant en réalité la plupart des micro-organismes sont très souvent soumises à des conditions environnementales instables. Pour comprendre l'adaptation bactérienne à des environnements changeants, nous avons porté une étude où la croissance et l'expression génique des bactéries uniques d'E.Coli qui croissent dans un dispositif microfluidique sont suivies dans le temps. Pendant que ces bactéries sont soumisses à des changements environnementaux, nous examinons le comportement des gènes-clés suivis par des protéines fluorescentes. Les résultats expérimentaux apportent une vue globale des stratégies d'allocation des ressources dans des environnements changeants et sont utiles pour évaluer les prédictions des modèles mathématiques d'allocation des ressources.

  • Titre traduit

    Quantification of bacterial resource allocation in changing environments on the single-cell level.


  • Résumé

    The relationship between bacterial growth and the environment has been well characterized over the last 50 years. In most studies, however, bacteria are maintained at steady-state growth even though in reality they are rarely in a constant environment. To investigate bacterial adaptation in changing environments, we track growth and gene expression of single-cell E. coli bacteria growing in a microfluidic device in changing environments. We examine the behavior of key ribosomal and metabolic genes in this context using fluorescent protein tags. The experimental results provide a detailed view of resource allocation strategies of individual bacteria in dynamically changing environments and are helpful in testing the predictions made by resource allocation models of bacterial growth.