Simulations de dynamique moléculaire et modélisation de membranes bactériennes supportées.

par Mariia Savenko

Projet de thèse en Physique

Sous la direction de Christophe Ramseyer et de Sarah Foley.

Thèses en préparation à Bourgogne Franche-Comté , dans le cadre de École doctorale Environnements, Santé , en partenariat avec Chrono-Environnement (laboratoire) depuis le 01-10-2018 .


  • Résumé

    Contexte : Etudier la possibilité d'utiliser des dispositifs lab-on-a-chip pour étudier les antibiotiques ciblant la membrane bactérienne. Méthodes actuelles : Pour le moment, toutes les études expérimentales utilisent des cellules bactériennes complètes et les études numériques utilisent des membranes flottantes. Méthode proposée : Déposition de membranes modèles sur des substrats hydrophiles pour pouvoir étudier les antibiotiques aux stades initiaux sans utiliser de cellules bactériennes réelles. En termes d'études numériques, nous prévoyons d'étudier les propriétés des couches déposees, telles que l'ordre des lipides et les changements de mobilité des lipides pour pouvoir tirer des conclusions sur le réalisme de ce modèle.

  • Titre traduit

    Molecular dynamics simulations and modeling of supported bacterial membranes.


  • Résumé

    Developing lab-on-a-chip devices is a promising area of research. This kind of tools can be particularly useful in developing new antibiotics which is really important as far as bacterial resistance grows. We propose to use model membranes on supports as a model for investigation of mew antibiotics targeting bacterial membranes. This can make first steps of investigations be cheaper and faster, moreover, more institutuions will be able to perform this kind of studies due to the low price and low demand of precautions. We will use numerical methods to compare properties of floating and deposited bacterial membranes and with this data we would be able to judge about the correspondence of the experimental data with deposited membranes to the real membranes of bacteria.