Développement d'une chimie combinatoire encodée pour l'identification de ligands spécifiques d'ADN G-quadruplex

par Pierre Rieber

Projet de thèse en Chimie Biologie

Sous la direction de Thomas Lavergne.

Thèses en préparation à l'Université Grenoble Alpes , dans le cadre de École doctorale chimie et science du vivant , en partenariat avec Département de Chimie Moléculaire (laboratoire) et de I2BM - Ingéniérie et Intéractions Biomoléculaires (equipe de recherche) depuis le 01-10-2018 .


  • Résumé

    Les acides nucléiques peuvent adopter des structures secondaires (G-quadruplex (G4), i-motif) qui sont impliquées dans la régulation des cellules saines mais également dans le développement de nombreux processus pathologiques. La conception de sondes chimiques et de candidats médicaments permettant respectivement de mieux comprendre le rôle de ces structures in vivo et d'ouvrir de nouvelles vois thérapeutiques suscite dès lors un très grand intérêt. Dans le cadre de ce projet, nous allons développer une nouvelle stratégie permettant l'émergence de ligands spécifiques de conformations particulières de G4. Pour ce faire, nous allons construire et évaluer une vaste librairie combinatoire de molécules fonctionnellement enrichies pour la reconnaissance des G4. Nous tirerons profit d'une technologie d'encodage récemment mise au point pour mettre en place des processus de sélection in vitro qui permettront d'identifier, à haut-débit et à moindre coût, les ligands les plus affins et les plus spécifiques.

  • Titre traduit

    Development of combinatorial encoded chemistry for the identification of specific ligands of G-quadruplex DNA structure


  • Résumé

    Nucleic acids are able to adopt secondary structures (G-quadruplex (G4), i-motif) which are involved in cells regulation as well as the development of pathological process. Conception of new chemical probes and therapeutic candidates respectively allow to better understand their goal in vivo structures and to discover new therapeutic pathways. In this project, we will develop a new strategy allowing the discovery of new specific G4-ligands of different conformations. To do so, we will build and evaluate a vast combinatorial library of fonctionnaly rich molecules enriched for G4 recognizing. Furthermore, we will use a new DNA-encoded chemical library recently tuned to set up in vitro selection process which allow the identification, high-throughput process, of more specific and more affine ligands.