LA NAGEOIRE PECTORALE CHEZ LE POISSON ZÉBRÉ COMME MODÈLE DE L'ORGANOGENÈSE PRÉCOCE DES MEMBRES ANTÉRIEURS CHEZ LES VERTÉBRÉS

par Thi ngoc hanh Nguyen

Projet de thèse en Sciences de la vie et de la santé

Sous la direction de Nadine Peyriéras.

Thèses en préparation à Paris Saclay , dans le cadre de École doctorale Signalisations et réseaux intégratifs en biologie (Le Kremlin-Bicêtre, Val-de-Marne ; 2015-....) , en partenariat avec Cnrs USR 3695 - BioEmergences (laboratoire) et de Université Paris-Sud (établissement de préparation de la thèse) depuis le 01-09-2017 .


  • Résumé

    Déchiffrer comment les cellules se comportent individuellement et collectivement dans le tissu en développement est essentiel à notre compréhension de l'organogenèse. Les propriétés cellulaires en termes de forme, d'adhérence et de motilité sont explorées et quantifiées au moyen de l'imagerie 3D+temps à haute résolution spatiale et temporelle de la nageoire pectorale en croissance. Le (la) candidat€ caractérisera les dynamiques cellulaires dans les lignées transgéniques de poisson-zébré exprimant de manière ubiquitaire les protéines de fusion H2B-mCherry ou hRas-eGFP, marquant le noyau et la membrane cellulaire respectivement. Les données acquises seront traitées par le workflow BioEmergences pour extraire le taux de prolifération cellulaire, la distribution et l'orientation des divisions cellulaires, les descripteurs de la forme des cellules et des nageoires et leur évolution. La comparaison entre animaux de type sauvage et mutants sera utilisée pour élucider les mécanismes génétiques et moléculaires qui sous-tendent la formation des nageoires. Nous nous intéresserons en particulier au rôle de la signalisation Fgf dans la régulation du développement des nageoires. Les conséquences de la perturbation de la signalisation Fgf seront observées dans la lignée mutante ikarus (fgf24) ou en présence de la drogue SU5402 bloquant le récepteur Fgf type 1 ou par injection d'oligonucléotides modifiés par un groupement morpholine ciblant les molécules Fgf connues pour être exprimées dans le tissu de la nageoire. Ce travail fournira de nouvelles perspectives sur la dynamique cellulaire, moléculaire et génétique sous-jacente à l'organogenèse embryonnaire précoce. Au cours de ce projet, le (la) candidat(e) sera formé(e) pour acquérir les compétences suivantes: génétique du poisson zébré, imagerie confocale, microscopie multi-photonique et feuille de lumière, traitement d'image avancé. Les autres compétences comprennent: rédaction de publications, présentation orale, rédaction de textes scientifiques et communication pour différents types de publics.

  • Titre traduit

    THE ZEBRAFISH PECTORAL FIN AS A MODEL FOR FORELIMB EARLY ORGANOGENESIS IN VERTEBRATES


  • Résumé

    Deciphering how individual cells behave within the developing tissue is essential to our understanding of organogenesis. Cell properties in terms of shape, adhesion and motility are explored and quantified based on high-resolution 3D+time imaging of the growing pectoral fin. The candidate will characterize cell dynamics in zebrafish transgenic lines ubiquitously expressing H2B-mCherry or hRas-eGFP fusion proteins, staining cell nucleus and membrane respectively. The acquired data will be processed by the BioEmergences workflow to extract the cell proliferation rate, the distribution and orientation of cell divisions, descriptors of cell shape and fin shape through time. The comparison between wild type and mutant backgrounds will be used to tackle the genetic and molecular mechanisms underlying the fin formation. We will in particular focus on the role of Fgf signaling in the regulation of fin development. Consequences of Fgf signalling perturbation will be observed in the mutant fish line ikarus (fgf24) or in the presence of the drug SU5402 blocking Fgf type 1 receptor or through the injection of morpholino modified oligonucleotides targeting Fgf molecules known to be expressed in the fin tissue. This work will provide new insights into the cellular, molecular and genetic dynamics underlying early embryo organogenesis. During this project, the candidate will be trained to acquire the following skills: zebrafish genetics, confocal, multi-photon and light-sheet microscopy imaging, advanced image processing. Other skills include: publication writing, oral presentation, science writing and communication.