Acquisition de relations à partir d'un nouveau domaine : application aux interactions aliment-médicament

par Tsanta Randriatsitohaina

Projet de thèse en Informatique

Sous la direction de Thierry Hamon.

Thèses en préparation à université Paris-Saclay , dans le cadre de École doctorale Sciences et technologies de l'information et de la communication , en partenariat avec Laboratoire interdisciplinaire des sciences du numérique (Orsay, Essonne ; 2021-....) (laboratoire) , ILES - Information, Langue Ecrite et Signée (equipe de recherche) et de Faculté des sciences d'Orsay (référent) depuis le 01-11-2017 .


  • Résumé

    Le contexte de cette thèse s'inscrit dans le domaine de la fouille de textes médicaux. L'intérêt central concerne l'extraction des informations sur les interactions entre l'alimentation et les médicaments. Les aliments peuvent en effet avoir des interactions avec les médicaments et cela peut mener à des conséquences malheureuses pour le patient. Ces interactions sont très peu étudiées. DrugBank [1], qui est la base de connaissances la plus complète sur la question, propose des informations textuelles sur les interactions pour moins de 10 % de médicaments. De plus, ces informations concernent essentiellement le moment de prise des médicaments (par exemple, pendant le repas). Il est ainsi nécessaire de proposer des méthodes de fouille de texte permettant d'analyser des articles scientifiques d'en extraire les informations relatives aux interactions entre aliment et médicament. On s'appuiera également sur les informations proposées par les ressources terminologiques et de données liées existantes.

  • Titre traduit

    Relation acquisition from a new domain: application to food-drug interactions


  • Résumé

    The context of this PhD thesis is the mining of biomedical texts. The main purpose is the extraction of interactions between food and drugs. Indeed, food may have interactions with drugs, and those can lead to harmful consequences on the patient's health and well-being. But, contrary to drug-drug interactions, food-drug interactions are less known and studied. DrugBank cite{drugbankURL}, which is the most complete knowledge base on the topic, records textual information about food-drug interactions for less than 10% of the recorded drugs, and it mainly provides information on the optimal drug intake time (e.g. meal time). Hence, it is necessary to propose text mining methods for the analysis of scientific literature and for the extraction of information related to intractions between food and drugs. Informations available in existing terminologies and linked data should be used.