Estimation paramétrique pour des modèles stochastiques de voies de signalisation de protéines

par Mahmoud Bentriou

Projet de thèse en Mathématiques appliquées

Sous la direction de Paul-Henry CournÈde et de Paolo Ballarini.

Thèses en préparation à Paris Saclay , dans le cadre de École doctorale INTERFACES : approches interdisciplinaires / fondements, applications et innovation (Palaiseau, Essonne ; 2015-....) , en partenariat avec Mathématiques et Informatique pour la Complexité et les Systèmes - EA 4037 (laboratoire) et de CentraleSupélec (2015-....) (établissement de préparation de la thèse) depuis le 01-09-2017 .


  • Résumé

    La thèse a pour objectif de développer des méthodes d'estimation des paramètres pour une classe de modèles dynamiques stochastiques en biologie. Parmi les méthodes envisagées, celles de type SMC-ABC (Sequential Monte-Carlo Approximate Bayesian Computation) semblent particulièrement adaptées. Un cas d'application avec des données réelles pour un modèle de réactions de protéines (Wnt pathway) sera étudié dans le cadre d'une collaboration avec l'Hôpital Debré (Paris).

  • Titre traduit

    Parameter Estimation for Stochastic models of Protein Reaction


  • Résumé

    The PhD objective is to develop parameter estimation methods and algorithms for a class of stochastic dynamic models in biology. Among the potential methods of interest, SMC-ABC (Sequential Monte-Carlo Approximate Bayesian Computation) offer promising perspectives. A real-case biological study will be conducted for a model of protein reaction (Wnt pathway) in a collaboration with Hôpital Debré (Paris).