Liaison spécifique de protéines virales aux membranes de corps lipidiques

par Dalila Ajjaji

Projet de thèse en Physique

Sous la direction de Abdou Rachid Thiam.

Thèses en préparation à Paris Sciences et Lettres , dans le cadre de École doctorale Physique en Île-de-France (Paris) , en partenariat avec LABORATOIRE DE PHYSIQUE STATISTIQUE DE L'E.N.S. (laboratoire) et de École normale supérieure (Paris ; 1985-....) (établissement de préparation de la thèse) depuis le 01-09-2016 .


  • Résumé

    Une étape majeure pour le maintien de l'état d'infection de l'hépatite C dans les cellules hépatiques est la liaison de la protéine Core de la capside à la membrane des gouttelettes lipidiques (GLs) formées dans le foie. Core se lie avec une hélice amphipathique qu'elle l'utilise pour passer de la membrane bicouche du réticulum endoplasmique (RE) à l'interface eau-huile des GLs. Le mécanisme de ce passage n'a pas encore été élucidé et la régulation de la liaison reste peu claire. Comprendre ce trafic physique de Core requiert entre autres une bonne connaissance de la biophysique de l'interaction protéine-membrane, spécialement sur des interfaces d'émulsions. Peu a été fait dans ce sens. Pour ce projet, nous chercherons à déterminer le mécanisme du trafic cellulaire de Core et ses partenaires entre le RE et les GLs. Nous adopterons pour cela une approche multidisciplinaire. Pour s'affranchir des complexités liées aux multiples interactions de Core, et qui empêchent présentement une compréhension de la liaison de la protéine, nous reconstituerons sa liaison sur des membranes modèles. Nous formerons des gouttes d'émulsions huile-dans-eau, mimant les GLs, et des vésicules mimant le RE. Nous déterminerons ainsi les conditions favorisant la liaison de Core sur les GLs. Cette approche, couplée avec des manips in vivo, sera innovante et apportera une compréhension qui fait actuellement défaut.

  • Titre traduit

    Specific binding of viral proteins to lipid droplet membranes


  • Résumé

    A major step for the maintenance of the hepatitis C infection state in the cells is the binding of the Core protein from the capsid to the lipid droplets (LD) membrane formed in the liver. Core binds with an amphipathic helix to use it from the bilayer membrane of the endoplasmic reticulum (ER) to the water-oil interface of the LD. The mechanism of this passage has not yet been elucidated and the regulation of the link remains unclear. Understanding this physical Core traffic requires, among other things, a good knowledge of the biophysics of protein-membrane interaction, especially on emulsion interfaces. Little has been done in this direction. For this project, we will investigate the mechanism of cellular traffic between Core and its partners between ER and LD. We will adopt a multidisciplinary approach. To overcome the complexities associated with the multiple interactions of Core, and which currently prevent an understanding of the binding of the protein, we will reconstitute its binding on model membranes. We will form drops of oil-in-water emulsions, mimicking the LD, and vesicles mimicking the RE. We will thus determine the conditions favoring the binding of Core on the LD. This approach, coupled with in vivo manipulations, will be innovative and bring an understanding that is currently lacking.