Analyses in silico et fonctionnelle des gènes rap-phr dans le groupe du Bacillus cereus

par Priscilla Cardoso

Projet de thèse en Microbiologie

Sous la direction de Didier Lereclus.

Thèses en préparation à Paris Saclay en cotutelle avec l'Université de Londrina , dans le cadre de École doctorale Agriculture, Alimentation, Biologie, Environnement, Santé (2015-.... ; Paris) , en partenariat avec MICALIS- Microbiologie de l'Alimentation au service de la santé humaine (laboratoire) , UMR Micalis - Pôle Risques- Equipe GME Génétique Microbienne et Environnement (equipe de recherche) et de AgroParis Tech (France) (établissement de préparation de la thèse) depuis le 02-03-2015 .


  • Résumé

    De nombreux processus bactériens sont contrôlés par des systèmes de communication cellulaire de type quorum-sensing. Les systèmes Rap-Phr sont des systèmes de quorum-sensing dans lesquels les protéines Rap régulent des processus clés tels que la sporulation, la formation du biofilm, la conjugaison ou compétence chez Bacillus subtilis. L'activité des protéines Rap est inhibée par un peptide Phr associé. Le Phr est produit dans la bactérie sous la forme pro-peptide, il est ensuite sécrété et maturé dans le milieu extracellulaire puis réimporté dans la bactérie pour jouer son rôle d'inhibiteur sur la protéine Rap. L'objectif de la thèse est l'étude des systèmes rap-phr dans les espèces du groupe Bacillus cereus. Cette étude comprend une analyse in silico des systèmes rap-phr au sein du groupe cereus et une analyse fonctionnelle des systèmes rap-phr plasmidiques dans la souche modèle Bacillus thuringiensis HD-73.

  • Titre traduit

    In silico and functional analysis of rap-phr genes in Bacillus cereus group


  • Résumé

    Several bacterial processes are controlled by quorum-sensing communication systems. In the Rap-Phr quorum-sensing systems, the Rap proteins regulate keys processes such as sporulation, biofilm formation, conjugation and competence in Bacillus subtilis. Rap activity is inhibited by a cognate Phr peptide. Phr is produced by the bacteria in a pro-peptide form, then it is secreted, extracellularly processed and reimported into the bacteria to inhibit Rap protein. The objective of this thesis is to study the rap-phr systems in the Bacillus cereus group species. This study include an in silico analysis within cereus group and a functional analysis of plasmid rap-phr systems in the model strain Bacillus thuringiensis HD-73.