In vitro directed enzyme evolution: : a self-selection using molecular program

par Remi Sieskind

Projet de thèse en Biochimie

Sous la direction de Yannick Rondelez.

Thèses en préparation à Sorbonne Paris Cité , dans le cadre de 563 médicament, toxicologie, chimie, imageries (MTCI) , en partenariat avec Laboratoire Gulliver - CNRS/ESPCI (equipe de recherche) depuis le 08-09-2015 .

  • Titre traduit

    Evolution dirigée d'enzyme in vitro : les programmes moleculaires au service de l'auto-sélection

  • Pas de résumé en français disponible.

  • Résumé

    Directed enzyme evolution mimics natural evolution to change functions or activities of biocatalysts towards non-natural purposes. In this work, we propose to use DNA-based molecular programs, to link the activity of an enzyme to the amplification of its own gene. We use different kind of compartments to link genotype and phenotype and then to assess completely in vitro a library of mutants of the considered enzyme. This way, a gene population randomly mutated can be enriched in the genes of the most active mutants. To test this method, we first target the activity of the Nb.BsmI nicking enzyme that recognizes the 5’-GAATGCN-3’ sequence and cuts only the bottom strand.