Exploration génétique de la polyploïdie chez les genévriers de l'Est de la région Méditerranéenne : Valeurs adaptatives et implications évolutives.

par Perla Farhat

Projet de thèse en Biologie

Sous la direction de Thierry Robert.

Thèses en préparation à Paris Saclay en cotutelle avec l'Université Saint Joseph (USJ) , dans le cadre de Sciences du Végétal : du gène à l'écosystème , en partenariat avec ESE Écologie, Systématique et Évolution (laboratoire) , Evolution des Angiospermes (equipe de recherche) et de Université Paris-Sud (établissement de préparation de la thèse) depuis le 01-11-2016 .


  • Résumé

    Les forêts méditerranéennes se caractérisent par leur grande richesse en espèces arborescentes constitutives ou associées pour divers genres majeurs notamment le genre Juniperus. A l'Est de la région Méditerranéenne, le chevauchement des aires de répartition de J. excelsa et de J. polycarpos ainsi que leur proximité génétique laisse supposer que l'hybridation entre eux est probable aboutissant à J. foetidissima qui est potentiellement hexaploïde. Pour explorer la polyploïdie de J. foetidissima on va: échantillonner des populations de J. excelsa, J. foetidissima et J. polycarpos, évaluer leur taille de génome, faire germer leur graines, construire leur caryotype, étudier diverses approches de génomique comparée, bioinformatique et bio-analyse, effectuer le séquençage comparatif d'une série de gènes précis pour élucider la divergence entre ses espèces.

  • Titre traduit

    Exploring the genetic polyploidy of Junipers in the eastern of the Mediterranean region: Adaptive Values and evolutionary implications.


  • Résumé

    The Mediterranean forests are characterized by their high diversity in tree species that belongs to various genera such as Juniperus. In the East of the Mediterranean region, the overlap of J. excelsa and J. polycarpos ranges and their genetic proximity suggests that the hybridization between those 2 species is possible leading to J. foetidissima that is potentially hexaploid. To explore the polyploidy of J. foetidissima we will: sample populations of J. excelsa, J. polycarpos and J. foetidissima, discover their genome size, optimize their seeds germination protocols, build their karyotype, study various approaches of comparative genomics, bioinformatics and bio-analysis, perform comparative sequencing of a series of specific genes to elucidate the difference between those species.