Eléments mobiles et évolution génomique à grande échelle chez les Archées Thermococales

par Catherine Badel

Projet de thèse en Sciences de la vie et de la santé

Sous la direction de Jacques Oberto.

Thèses en préparation à Paris Saclay , dans le cadre de Structure et Dynamique des Systèmes Vivants , en partenariat avec Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) (laboratoire) et de Université Paris-Sud (établissement de préparation de la thèse) depuis le 01-09-2016 .


  • Résumé

    Le projet de thèse vise à étendre nos connaissances sur l'évolution génomique chez les Thermococcales et particulièrement sur le rôle joué par l'intégrase de pTN3 de Thermococcus nautili et par d'autres intégrases d'éléments mobiles. L'étude pourra être étendue à d'autres archées et aux bactéries, par exemple du genre Rhizobium. L'analyse comparative de ces différentes intégrases devrait nous permettre d'identifier le ou les domaine(s) responsable(s) de l'activité particulière de l'intégrase de pTN3 et éventuellement d'identifier d'autres intégrases possédant cette propriété. Les conséquences adaptatives des activités des intégrases seront également étudiées. Ce projet met en jeu des compétences en microbiologie, génétique, biochimie et bioinformatique.

  • Titre traduit

    Mobile elements and large scale genome evolution in Archaea Thermococcales


  • Résumé

    The PhD project aims to expand our knowledge of genomic evolution in Thermococcales and particularly the role played by the Thermococcus nautili plasmid pTN3 integrase and other mobile elements integrase. The study will be extended to other archaea and bacteria, for example of the genus Rhizobium. The comparative analysis of these different integrases should allow us to identify the area (s) responsible (s) of the particular activity of pTN3 integrase and possibly identify other integrase with this property. Evolutionary consequences of the activities of these integrases will also be studied. This project requires skills in microbiology, genetics, biochemistry and bioinformatics.