Imagerie du Modele alevin de poisson / Application a la toxicologie du developpement

par Diane Genest

Projet de thèse en Informatique

Sous la direction de Hugues Talbot.

Thèses en préparation à Paris Est , dans le cadre de MSTIC : Mathématiques et Sciences et Technologies de l'Information et de la Communication , en partenariat avec LIGM - Laboratoire d'informatique Gaspard-Monge (laboratoire) et de A3IS - Algorithme, Architecture, Analyse et Synthèse d'Image (equipe de recherche) depuis le 14-04-2016 .


  • Résumé

    Dans le contexte d'une étude toxicologique environnementale, le projet vise à évaluer la toxicité de substances intervenant dans la composition de produits cosmétiques sur un modèle représentatif de chaines alimentaires aquatiques : l'embryon de poisson (Oryzias latipes ou Danio rerio). Le projet se compose de deux axes principaux : - Mesure automatique des effets d'agents tératogènes en toxicité du développement. Cet axe nécessitera le développement de procédures d'analyse d'image permettant la détection et la mesure précise et répétable d'anomalies du développement chez l'embryon de poisson. - Microscopie quantitative de l'alevin in vivo en toxicologie systémique. Cet axe consistera en la mise en place d'une méthode par analyse d'images capable de quantifier précisément les volumes micro-injectés. Ce travail permettrait à terme de palier les limites du mode d'exposition des embryons par balnéation. Les résultats attendus de ce travail sont : • Une nouvelle palette d'outils informatiques fiables et efficaces d'investigation en écotoxicité sur le modèle embryon de poisson par analyse d'image, permettant d'obtenir des mesures objectives et reproductibles ; • Une chaîne complète, validée et automatique d'acquisition et de traitement de séquences d'images pour l'évaluation toxicologique de substances chimiques.

  • Titre traduit

    Fish Embryo model Imaging / Application in development toxicology


  • Résumé

    As part of an environmental toxicological study, the project is intended to assess the toxicity of substances that are employed in cosmetics composition. For that, a representative model of the aquatic food chain is used based on fish embryo (Oryzias latipes or Danio rerio). The research is composed of two main axis : - Automated measurement of teratogenic substances effects in developmental toxicology. This axis will require the development of image processing methods allowing the detection and the precise/repeatable measure of development abnormalities in fish embryo. - Quantitative microscopy if in vivo fish embryo in systemic toxicology. This axis will consist of setting up a method based on image processing and to precisely quantify micro-injected volumes. This work will overcome the limitations linked to bathing exposure mode. Expected results from this work include : - A new reliable and efficient IT toolbox, allowing to obtain objective and repeatable measurements by image processing in fish embryo ecotoxicity. - A complete, automatic and validated chain of image sequences acquisition and processing, for toxicological assessment of chemical substances.