Biosynthèse combinatoire d'antibiotiques pyrrolamides chez Streptomyces

par Céline Aubry

Projet de thèse en Sciences de la vie et de la santé

Sous la direction de Sylvie Lautru.

Thèses en préparation à Paris Saclay , dans le cadre de Structure et Dynamique des Systèmes Vivants , en partenariat avec Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) (laboratoire) et de Université Paris-Sud (établissement de préparation de la thèse) depuis le 01-10-2015 .


  • Résumé

    Les pyrrolamides constituent une famille de métabolites secondaires ayant de nombreuses activités biologiques (antibactériennes, antivirales, antifongiques…) mais trop toxiques pour être utilisés en médecine. Notre équipe s'intéresse à la biosynthèse de ces molécules et a déjà caractérisé la biosynthèse de deux molécules de cette famille, la congocidine et la distamycine. La caractérisation de la biosynthèse d'une troisième molécule a été entreprise. Nous cherchons maintenant à développer des approches de biosynthèse combinatoire et de mutasynthèse pour synthétiser des analogues de pyrrolamides aux propriétés biologiques intéressantes. La biosynthèse combinatoire utilise des combinaisons originales de gènes impliqués dans diverses voies de biosynthèse de produits naturels pour générer des analogues de ces produits. Le doctorant aura pour objectifs principaux de participer à la caractérisation des nouvelles voies de biosynthèse des pyrrolamides étudiés au laboratoire et de développer une approche de biosynthèse combinatoire basée sur cette famille de métabolites afin de produire de nouveaux pyrrolamides et de déterminer les facteurs clés à considérer (interactions protéiques, spécificités de substrat…) pour développer de telles approches.

  • Titre traduit

    Combinatorial biosynthesis of pyrrolamide antibiotics in Streptomyces


  • Résumé

    Pyrrolamides are a family of secondary metabolites that possess numerous biological activities (antibacterial, antiviral, antifungal ...) but are too toxic to be used in medicine. Our team is interested in the biosynthesis of these molecules and has characterized the biosynthesis of two molecules of this family, congocidine and distamycin. The characterization of the biosynthesis of a third molecule has been undertaken. We are now looking to develop combinatorial biosynthesis and mutasynthesis approaches to synthesize new pyrrolamides analogs with interesting biological properties. Combinatorial biosynthesis uses original combinations of genes from a variety of natural products biosynthetic pathways to generate analogues of these products. The main objectives of the PhD student will be (i) to participate to the characterization of new pyrrolamides biosynthetic pathways studied in the laboratory and (ii) to develop a combinatorial biosynthesis approach to produce new pyrrolamides and to identify key factors to consider (protein interactions, substrate specificities...) in the development of such approaches.