Libraries of dynamic peptides based on reversible native chemical ligation

par Cristian-Victor Rete

Thèse de doctorat en Chimie

Sous la direction de Nicolas Giuseppone.

Soutenue le 28-09-2018

à Strasbourg , dans le cadre de École doctorale Sciences chimiques (Strasbourg ; 1995-....) , en partenariat avec Institut Charles Sadron (Strasbourg) (laboratoire) .

Le président du jury était Ludovic Jullien.

Le jury était composé de Vladimir Torbeev.

Les rapporteurs étaient Ludovic Jullien, Sébastien Ulrich.

  • Titre traduit

    Bibliothèque de peptides dynamiques fondés sur la ligation chimique native réversible


  • Résumé

    La possibilité d'utiliser une nouvelle méthodologie pour l'échange de liaisons peptidiques dans des conditions aérobiques et biocompatibles a été étudiée. Nous décrivons l'optimisation de la ligation chimique native combinatoire dynamique (dynNCL) au niveau d'un résidu N-méthylcystéine en utilisant des peptides modèles. Nous employons en outre cette méthode optimisée pour le criblage de bibliothèques de peptides combinatoires dynamiques en présence et en l'absence d'un gabarit de type anticorps. L'effet que l'incorporation d'une jonction dynamique au sein de ligands non-anticorps a sur l'affinité a également été étudié. Nous proposons que dynNCL peut être utilisé pour la conception d'une nouvelle classe de séquences pouvant potentiellement conduire au premier exemple d'épissage de protéines artificielles.


  • Résumé

    The possibility to use a new methodology for peptide bond exchange in aerobic biocompatible conditions has been investigated. We describe the assay optimization of dynamic combinatorial native chemical ligation (dynNCL) at the N-methyl-cysteine residue using model peptides. We further employ this optimized method for the screening of dynamic combinatorial peptide libraries in the presence and the absence of an antibody template. The effect that dynamic junction incorporation into non-antibody ligands has upon affinity was also studied. We propose that dynNCL can be used for the creation of a new class of designer sequences which can potentially provide the first example of artificial protein splicing.



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