Relations entre l'infiltrat lymphocytaire et les caractéristiques moléculaires d'une cohorte de 135 patients présentant un cancer colorectal : prévalence de la délétion du locus Apobec 3

Relations between the lymphocytic infiltration and molecular characteristics of 135 patients with colorectal cancer : prevalence of deletion Apobec 3

• Auteur / Autrice : Fatou Agne
• Direction : Jean-Christophe Pagès, Meïssa Touré
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences de la Vie et de la Santé
• Date : Soutenance le 02/07/2013
• Etablissement(s) : Tours en cotutelle avec Université Cheikh Anta Diop (Dakar)
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Santé, Sciences Biologiques et Chimie du Vivant (Centre-Val de Loire)
• Partenaire(s) de recherche : Equipe de recherche : Morphogénèse et antigénicité du VIH et des virus des hépatites. Tours
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Jean-Christophe Pagès, Meïssa Touré, Babacar Fall, Jean Luc Darlix, Alassane Diatta
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Babacar Fall, Jean Luc Darlix

Mots clés

Mots clés contrôlés

Sondes moléculaires

Rétrovirus endogènes humains

Apolipoprotéines

Lymphocytes T

Aspect moléculaire

Cancer colorectal

Mots clés libres

Cancer colorectal

Infiltrat lymphocytaire

Marqueurs moléculaires

Apobec 3

HERVs

Colorectal cancer

Immune infiltrate

Molecular markers

Apobec 3

HERVs

Résumé

Le cancer colorectal est une affection multifactorielle qui conjugue des anomalies épigénétiques et des altérations moléculaires à une déstabilisation du génome. En dehors de deux processus bien établis, l’instabilité des microsatellites et l’instabilité des chromosomes, la déstabilisation du génome peut être consécutive à la réexpression d’éléments génétiques mobiles, HERV et LINEs-­‐1. Les HERVs ont un potentiel de modulation de l’immunité qui pourrait contrôler les réactions de l’hôte dans le processus de la carcinogenèse. Compte tenu du rôle que pourrait jouer les HERV, nous avons voulu déterminer la relation entre l’infiltrat lymphocytaire intratumoral et les différentes caractéristiques moléculaires des tumeurs. L’infiltrat lymphocytaire intratumoral a été évalué pour trois marqueurs (CD3, CD8 et CD45RO). Les marqueurs moléculaires analysés ont été : les mutations des gènes B-­‐raf, k-­‐ras et Pi3K, le statut des microsatellites, la méthylation de MLH1 et des LINEs-­‐1, un polymorphisme de C-­‐met et de HLA-­‐G. Ces marqueurs ont été comparés à la prévalence de la délétion du locus Apobec 3 pour une cohorte de 135 patients porteurs de cancer colorectal.

Colorectal cancer is a multifactorial disease associated to epigenetic abnormalities and molecular alterations inducing a destabilization of the cellular genome. Besides two well-­established processes, microsatellite instability and chromosome instability, the destabilization of the genome may follow mobilisation of endongenised mobile genetic elements, such as HERV or LINEs-­‐1. HERV have a potential to modulate immune response, which suggests that they could contribute to the process of carcinogenesis. We thus wanted to determine the relationship between intratumoral lymphocytic infiltration and the different molecular characteristics of tumours, taking into account factors that could influence the expression of HERV, such as the frequently observed deletion of a locus on 22q13 containing the Apobec 3 gene family. The intratumoral lymphocytic infiltration was assessed for three markers (CD3, CD8 and CD45RO). The molecular markers analysed were: the mutations of B-­‐raf, K-­‐ras and Pi3K genes, the instability status of microsatellites, the methylation of MLH1 and LINEs-­‐1, a polymorphism in C-­‐met and in HLA-­‐G. These markers were linked to the deletion of the locus containing Apobec 3 genes, in a cohort of 135 colorectal cancer patients.