La dengue au Cambodge : épidémiologie, évolution moléculaire, présentations cliniques, diagnostic de laboratoire et marqueurs de la sévéritéIAGNOSTIC DE LABORATOIRE ET MARQUEURS DE LA SEVERITE

Dengue in Cambodia : epidemiology, molecular evolution, clinical presentation, laboratory diagnostic and markers of severity

• Auteur / Autrice : Veasna Duong
• Direction : Thierry Dupressoir, Philippe Buchy
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie/Parasitologie
• Date : Soutenance le 09/12/2011
• Etablissement(s) : Montpellier 2 en cotutelle avec Royal University of Phnom Penh (Cambodge)
• Ecole(s) doctorale(s) : Systèmes Intégrés en Biologie, Agronomie, Géosciences, Hydrosciences, Environnement (Montpellier ; École Doctorale ; 2009-2015)
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Institut des sciences de l'évolution (Montpellier)
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Thierry Dupressoir, Philippe Buchy, Yves Buisson, Jean-Pierre Hugot, Roger Frutos, Y meng Chhour
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Yves Buisson, Jean-Pierre Hugot

Mots clés

Mots clés contrôlés

Viroses

Épidémiologie

Dengue

Mots clés libres

Cambodge

Dengue

Épidémiologie

Dynamique d'évolution

Sévérité

Cambodia

Dengue

Epidemiology

Evolution dynamic

Severity

Résumé

La dengue, maladie transmise par des moustiques, est causée par l'un des 4 sérotypes du virus de la dengue (DENV). Le Cambodge est un pays d'hyperendémicité de la dengue où les 4 sérotypes en co-circulent. Le programme national de lutte contre la dengue a été établi en 2000 et a fourni des données nécessaires dans la compréhension du profil épidémiologique et de l'évolution du DENV. La dynamique d'évolution virale est caractérisée par des événements de disparition et d'émergence de lignées au sein de chaque sérotype en fonction du temps. La dengue se présente sous différentes formes cliniques allant d'une forme asymptomatique aux formes sévères accompagnée d'un syndrome de choc (DSS) et le diagnostic différentiel est souvent compliqué. Dans des contextes cliniques différents et avec des profils biologiques variables, nous avons évalué un test de diagnostic précoce de détection de l'antigène NS1 de la dengue. De plus, nous avons identifié de nombreux profils d'expression biologique spécifiques aux cas de DSS qui pourraient être utilisés comme d'éventuelles cibles pour le développement de nouveaux traitements ou comme des marqueurs de pronostic.

Dengue infection, caused by one of the four serotypes of dengue virus (DENV), is a major cause of morbidity and mortality in the world with an estimated 50-100 million cases annually. In Cambodia, dengue is hyperendemic and all four serotypes are circulating. The active hospital-based surveillance has been established in 2000 and provided important insights in the understanding of the epidemiological profile and of the DENV evolution. The dynamic of evolution of DENV is characterized by complex patterns of lineage turnovers within each serotype, with lineages increasing and decreasing in frequency through time. Dengue manifests in various clinical forms - from asymptomatic to severe form with shock syndrome - and is sometimes difficult to differentiate from other febrile diseases. We have evaluated the performance of a recent diagnostic tool (NS1 antigen detection) - developed to identify dengue at a very early stage on the infection - depending on various clinical and biological patterns. Additionally, genome-wide expression analysis has characterized a large amount of gene signatures specific to dengue shock syndrome which could be used as prognostic markers as well as potential targets for drug design.