Analyse de la saisonnalité du paludisme au Togo et détection d’épidémies saisonnières

Analysis of malaria seasonality in Togo and detection of seasonal epidemics

• Auteur / Autrice : Anne Thomas
• Direction : René Écochard, Muriel Rabilloud, Nicolas Voirin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Epidémiologie, biostatistique
• Date : Soutenance le 08/12/2022
• Etablissement(s) : Lyon 1
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation
• Partenaire(s) de recherche : Laboratoire : Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive
• Jury : Président / Présidente : Delphine Maucort-Boulch
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Valérie Briand, Issaka Sagara, Kokou Agoudavi, André Garcia
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : Valérie Briand, Issaka Sagara

Mots clés

Mots clés contrôlés

Épidémiologie

Paludisme

Mots clés libres

Paludisme

Saisonnalité

Analyse spatio-Temporelle

Surveillance

Malaria

Seasonality

Spatial and temporal analysis

Surveillance

Résumé

Le paludisme est une maladie infectieuse due à des parasites du genre Plasmodium qui sont transmis à l’homme par des piqûres de moustiques femelles infectés, les Anopheles. Au Togo, le paludisme est un problème de santé publique majeur. En 2020, le nombre de cas de paludisme était estimé à 1,9 million dans ce pays et le nombre de décès dus au paludisme à 3 589. Selon l’Organisation Mondiale de la Santé, la surveillance doit être considérée comme une intervention essentielle dans la lutte contre le paludisme. L’objectif de cette thèse était d’apporter une meilleure connaissance spatio-temporelle du paludisme au Togo en s’intéressant spécifiquement à la saisonnalité. Pour cela le Programme National de Lutte contre le Paludisme (PNLP) du Togo a mis à notre disposition les données de cas confirmés de paludisme par district sanitaire et groupe cible de janvier 2008 à décembre 2017. La première étude a permis de décrire la saisonnalité du paludisme au Togo en utilisant une méthode de décomposition saisonnière et de fournir de nouveaux indicateurs de saisonnalité au PNLP afin d’éviter les ruptures de stocks en intrants antipaludiques dans les formations sanitaires lors des périodes de forte transmission du paludisme. A travers la deuxième étude, nous avons déterminé les périodes de plus forte transmission du paludisme dans le but d’apporter des informations supplémentaires au PNLP pour définir des programmes d’interventions sur mesure. La troisième étude a exploré la possibilité d’utiliser les données mensuelles sur le paludisme collectées par le PNLP, ainsi que des prédicteurs météorologiques et environnementaux pour prévoir le nombre mensuel de cas de paludisme au Togo.

Malaria is an infectious diseases caused by Plasmodium parasites that are transmitted to people through the bites of infected female mosquitoes, the Anopheles. Malaria is a major public health concern in Togo. In 2020, the number of malaria cases was estimated at 1.9 million in this country and the number of malaria deaths was estimated at 3,589. According to the World Health Organization, surveillance should be considered an essential intervention in malaria control. This thesis aimed to provide a better spatial and temporal knowledge of malaria in Togo, with a specific focus on seasonality. For this purpose, data of confirmed malaria cases by health district and target group from January 2008 to December 2017 were provided by the National Malaria Control Programme (NMCP) of Togo. The first study described the seasonality of malaria in Togo using a seasonal and trend decomposition method and provided new indicators of malaria seasonality to the NMCP in order to avoid stock-outs of malaria commodities in health facilities during periods of high malaria transmission. In the second study, we determined the periods of highest malaria transmission in order to provide additional information to the NMCP to define tailored intervention programmes. The third study explored the possibility of using monthly malaria data collected by the NMCP and meteorological and environmental predictors to forecast the monthly number of malaria cases in Togo.