Etude de voies de dégradation par des approches génétiques et biochimiques : application au D-glucarate et au galactarate chez la bactérie Acinetobacter baylyi ADP1

by Asadollah Aghaie

Doctoral thesis in Biochimie.Génétique

Under the supervision of Marcel Salanoubat.

defended on 2009

in Paris 6 .

  • Alternative Title

    Study of degradation pathways by genetic and biochemical approaches : application to D-glucarate and galactarate in the bacterium Acinetobacter baylyi ADPI


  • Abstract not available


  • Abstract

    Cette étude a été effectuée sur Acinetobacter baylyi ADP1, qui est au laboratoire notre organisme « modèle » pour étudier le métabolisme. Cette bactérie du sol, présente un métabolisme polyvalent qui permet de dégrader de nombreuses sources de carbone. De plus elle est particulièrement adaptée aux modifications génétiques à haut débit. Des ressources ont été construites au laboratoire, incluant la séquence de son génome et la construction d’une collection complète de mutants de délétion. ADP1 étant capable d’utiliser le D-glucarate/galactarate comme seule source de carbone, nous avons identifié cinq gènes potentiellement impliqués dans la voie de dégradation de ces deux hexarates en caractérisant la capacité des mutants de l’ensemble de la collection (~2500) à utiliser ces produits comme seule source de carbone. Les produits de ces quatre gènes, ont été caractérisés biochimiquement pour en déterminer la fonction ainsi que leurs caractéristiques cinétiques. Nous avons aussi étudié la régulation de ces gènes en terme de transcription et d’expression. Nous avons mis en évidence l’induction de la voie par les deux hexarates, découvert un régulateur négatif et suggéré les régions régulatrices de cet « opéron » de dégradation.

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Informations

  • Details : 1 vol. ( [163] p.)
  • Annexes : Bibliogr. p. 145-153.

Where is this thesis?

  • Library : Université Pierre et Marie Curie. Bibliothèque Universitaire Pierre et Marie Curie. Section Biologie-Chimie-Physique Recherche.
  • Available on site in the applicant institution
  • Odds : T Paris 6 2009 317
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