Rôle du quorum-sensing et prévalence des bactériophages chez la bactérie phytostimulatrice Azospirillum

by Mickaël Boyer

Doctoral thesis in Écologie microbienne

Under the supervision of René Bally and Florence Wisniewski-Dyé.

defended on 2008

in Lyon 1 .

  • Alternative Title

    Role of quorum-sensing and bacteriophage prevalence in the phytostimulatory bacterium Azospirillum


  • Abstract

    The aim of this work was to identify quorum-sensing (QS) regulated functions in the phytobeneficial bacterium Azospirillum. Inactivation of signal molecules involved in QS has no deleterious effect on the in vitro phytostimulatory properties of strains B518 and TVV3 (isolated from rice). By combining a targeted approach and a global proteomic approach, QS was shown to regulate functions linked to adaptation to the plant, notably to root colonization, in strain B518. In strain TVV3, no QS-regulated function was identified but QS genes were localized in an atypical environment containing genes of prophage origin. The isolation of phage particles in strain TVV3 led to the characterization of temperate phages in ten other strains and to the sequencing of the first bacteriophage genome isolated from an Azospirillum strain. This work indicates that QS regulation is strain-specific and reveals bacteriophage prevalence in Azospirillum


  • Abstract

    Le but de ce travail était d’identifier les fonctions régulées par quorum-sensing (QS) chez la bactérie phytostimulatrice Azospirillum. Les effets phytobénéfiques in vitro des souches B518 et TVV3 (isolées du riz) ne sont pas altérées par l’inactivation des molécules signal impliquées dans le QS. La combinaison d’une approche ciblée et d’une approche globale par protéomique montre que le QS régule des fonctions liées à l’adaptation à la plante, notamment à la colonisation racinaire chez B518. Chez TVV3, aucune fonction régulée par QS n’a pu être identifiée mais les gènes impliqués dans le QS sont localisés dans un environnement atypique, constitué de gènes prophagiques. La mise en évidence d’un prophage chez TVV3 a conduit à la caractérisation de phages tempérés chez dix autres souches et au séquençage du premier génome d’un bactériophage isolé d’Azospirillum. Ce travail montre que la régulation de type QS est souche spécifique et révèle la prévalence des phages chez Azospirillum

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Informations

  • Details : 1 vol. (155 f.)
  • Annexes : Réf. bibliogr. f. 116-152

Where is this thesis?

  • Library : Université Claude Bernard (Villeurbanne, Rhône). Service commun de la documentation. BU Sciences.
  • Available for PEB
  • Odds : T50/210/2008/242bis
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