Profils d'expression de lymphomes

by Benoît Thomas Marc Ballester

Doctoral thesis in Bio-informatique

Under the supervision of Rémi Houlgatte.

defended on 2006

in Aix-Marseille 2 , under the authority of Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille) , in a partnership with Université d'Aix-Marseille II. Faculté des sciences (autre partenaire) .

  • Alternative Title

    Expression profiling of lymphomas


  • Abstract

    The microarray technology forms a powerful tool to analyse genomic events at the origin of different pathologies. The uses of this technology in cancer research raised tremendous expectations not only because it allowed to define and classify tumours but also to predict the evolution of the tumour for a patient. In this thesis we have characterised lymphomas groups not yet defined molecularly. In a first study considering T cell lymphomas, we have identified from the controversy class of unspecified T cell lymphoma, three groups presenting molecular signatures distinct from well know entities. The analysis of transcriptional profiles from transformed B cell lymphoma (MZL) revealed a common process with follicular lymphomas. Finally functional annotation approaches using Gene Ontology allowed us to assign functions to transcriptional signatures from rare lymphomas. The field of microarray data analysis is an active research domain which to date do not allow the use of this technology at the patient’s feet.


  • Abstract

    La technologie des puces à ADN constitue un outil extrêmement puissant d’analyse à haut débit d’événements génomiques à l’origine de pathologies. L’utilisation en cancérologie de la technologie des microrarrays a suscité de formidables espoirs tant les résultats permettaient non seulement de définir et de classer les tumeurs mais aussi de prédire l’évolution de la tumeur chez un patient. Au cours de cette thèse, nous avons cherché à caractériser des groupes de lymphomes encore mal identifiés moléculairement. Dans une première étude sur les lymphomes T périphériques, nous avons identifié parmi la classe controversée des lymphomes T non spécifiés, trois sous-groupes qui présentent des signatures moléculaires distinctes des autres échantillons connus. D’autre part l’analyse des profils transcriptionnels de la transformation des lymphomes B (MZL) a permis de révéler des processus communs avec la transformation des lymphomes folliculaires. Enfin, grâce au Gene Ontology, des approches d’annotation fonctionnelle nous ont permis d’assigner des fonctions à des signatures transcriptionnelles de groupes de lymphomes rares. Le domaine de l’analyse de données issues des puces à ADN est un domaine de recherche actif mais ne permet pas à ce jour d’appliquer cette technologie au chevet du malade

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Informations

  • Details : 1 vol. (173 f.)
  • Notes : Publication autorisée par le jury
  • Annexes : Bibliogr. : f.158-173

Where is this thesis?

  • Library : Université Aix-Marseille (Marseille. Luminy). Service commun de la documentation. Bibliothèque de sciences.
  • Available for PEB
  • Odds : 44044
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