Contribution à l'étude de protéines impliquées dans le contrôle de la stabilité des ARNm chez le xénope

• Auteur / Autrice : Sylvie Bonnet
• Direction : Beverley Osborne
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie
• Date : Soutenance en 2002
• Etablissement(s) : Rennes 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Stabilité

ARN

Xénopes

Protéines de liaison

Résumé

La protéine EDEN-BP se lie au motif EDEN riche en U/purine et est impliquée dans la désadénylation d'ARNm. EDEN-BP présente 3 motifs de liaison à l'ARN (RRM, RNA Recognition Motif). Les 2 premiers RRM sont situés en N-terminal et une région "linker" les séparent du troisième RRM situé en C-terminal. La cartographie des domaines d'EDEN-BP nécessaires à la reconnaissance spécifique d'EDEN a été réalisée à l'aide de protéines recombinantes en utilisant la technique du transfert de marquage. Les RRM1 et 2, et une information de séquence dans le "linker" sont nécessaires à la fixation d'EDEN-BP à l'EDEN. Des expériences de gel-retard et de double hybride indiquent que la forme active du complexe EDEN/EDEN-BP contient un dimère d'EDEN-BP. Par ailleurs, la chromatographie d'affinité avec ligand ARN a été mise au point pour purifier des facteurs impliqués dans la déstabilisation des ARN présentant un motif AUUUA chez le xénope. 6 facteurs spécifiques de ce motif ont été observés.