Determination par resonance magnetique nucleaire de la structure tridimensionnelle de petites proteines : _ peptide chimere stabilise par des ponts disulfure _ domaine carboxy-terminal de la sous-unite p44 du facteur de transcription humain tfiih

• Auteur / Autrice : Esther Kellenberger
• Direction : Bruno Kieffer
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Psychologie
• Date : Soutenance en 2000
• Etablissement(s) : Strasbourg 1

Résumé

La premiere partie traite d'ingenierie des proteines. Une sequence de type rgd a ete introduite dans une toxine de scorpion contenant trois ponts disulfure. La toxine chimere possede des proprietes antiagregantes. Sa structure tridimensionnelle revele qu'une helice alpha peut mimer un coude beta de type ii. Une deuxieme partie s'interesse aux proteines qui lient le zinc et qui sont impliquees dans la transcription des genes de classes ii chez les eucaryotes. _ une revue bibliographique decrit les proprietes du zinc et les differents motifs structuraux de liaison au zinc. _ un chapitre est consacre a la purification de la sous-unite hrpb10alpha de l'arn polymerase ii humaine. Cette sous-unite de 58 acides amines lie un ion zn 2 +. Le comportement biochimique ainsi que les premiers spectres enregistres sur la proteine purifiee mettent en evidence une tendance a l'agregation. _ un chapitre presente la determination de la structure tridimensionnelle du domaine carboxy-terminal de la sous-unite p44 (p44 3 2 1 - 3 9 5) de tfiih. Tfiih est un facteur de base de la transcription. Il est aussi un acteur essentiel de la reparation de l'adn par excision de nucleotides. Le domaine p44 3 2 1 - 3 9 5 lie deux ions zn 2 +. L'etude structurale revele un feuillet beta antiparallele a trois brins associe a une helice alpha. Elle temoigne egalement d'une dynamique localisee autour de l'un des sites de liaison au zinc. Le motif de coordination des ions zinc de p44 3 2 1 - 3 9 5 est original, bien que la topologie du domaine soit commun a d'autres proteines de liaison au zinc. Le travail sur p44 a fait appel a deux techniques propres a la resonance magnetique nucleaire des macromolecules biologiques : (1) le marquage isotopique et (2) l'automatisation de l'attribution des pics de correlation noes. L'utilisation et l'evaluation de ces techniques sont detaillees dans une partie methodologie.