Etude de la diversité des populations de colletotrichum lindemuthianum, agent responsable de l'anthracnose du haricot, à l'échelle mondiale

Genetic diversity of worldwide populations of colletotrichum lindemuthianum, the causal agent of anthracnose of common bean

• Auteur / Autrice : Jean-Vincent Fabre
• Direction : Michel Dron
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1997
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Colletotrichum lindemuthianum est un champignon deuteromycete responsable de l'anthracnose du haricot commun (phaseolus vulgaris). Cette maladie est particulièrement importante dans les zones tropicales d'altitude ou les conditions climatiques fraiches et humides sont propices au développement des épidémies. Dans ces régions, les résistances nouvellement introduites sont rapidement surmontées par l'émergence de nouvelles races fongiques. La grande variabilité des populations pathogènes est supposée être la cause de la faible durabilité des gènes de résistance introduits. La diversité génétique des populations de c. Lindemuthianum a été estimée tant pour des marqueurs de pouvoir pathogène que pour des marqueurs moléculaires. Une collection de souches provenant des quatre principales zones de production (Afrique de l'est, Europe, Amérique centrale et Amérique latine) a tout d'abord été étudiée puis dans un second temps, une étude des populations pathogènes à l'échelle locale a été réalisée en Tanzanie. Ces études ont révèle une importante diversité génétique chez c. Lindemuthianum quelque soit le type de marqueur considèré. Sur la base des profils de restriction des its, deux groupes moléculaires ont été définis. Une corrélation entre le pouvoir pathogène des souches et le groupe moléculaire auquel elles appartiennent pourrait exister. Les souches provenant d'Amérique centrale sont les plus diversifiées du point de vue du pouvoir pathogène. Sur la base des profils d'amplification rapd, elles apparaissent également comme les plus éloignées. Cette région pourrait constituer un centre de diversité majeur de cet agent pathogène. La mutation et la sélection par l'hôte apparaissent comme les principales forces générant la diversité et conduisant à la différenciation des populations