Établissement d'un ensemble continu de cosmides dans la région HLA-A/HLA-F et identification d'un groupe de gènes après séquençage d'un cosmide de 37 KB

Systematic sequencing of the human hla-a/hla-f region: establishment of a cosmid contig and identification of a new gene cluster within 37 kb of sequence

• Auteur / Autrice : Maïna Lepourcelet
• Direction : Francis Galibert
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques
• Date : Soutenance en 1996
• Etablissement(s) : Rennes 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Hémochromatoses

Antigènes d'histocompatibilité HLA

Résumé

La region de classe i du complexe majeur d'histocompatibilite est caracterisee par une forte densite en genes et pseudogenes et une organisation structurale complexe. Afin de determiner la structure complete de la region hla-a/hla-f, qui a ete supposee contenir le gene de l'hemochromatose, et identifier l'ensemble des genes, une strategie de sequencage systematique a ete developpee. Ce travail decrit l'etablissement d'un ensemble continu de cosmides couvrant la region et l'analyse d'une sequence de 37 kb de l'un des cosmides. Quatre nouveaux genes, regroupes autour du gene hcg-v prealablement localise dans la region, ont ete identifies. Deux d'entre eux contiennent un motif en doigt a zinc caracteristique des proteines capables de s'associer a l'adn. L'un, fortement exprime dans la prostate, appartient a la famille des genes codant des proteines contenant le motif en doigt a zinc du type c3hc4 et est egalement caracterise par la presence d'un domaine hautement conserve, domaine de type b30-2, identifie dans de nombreux genes de la region de classe i. Le second, d'expression ubiquitaire, code l'equivalent de la sous-unite a12. 2 de la polymerase i de levure et est egalement l'equivalent du gene murin tctex6. Parmi les 2 autres genes, l'un n'a pas ete caracterise alors que l'autre, specifiquement exprime dans le testicule, est l'equivalent du gene murin tctex4. Ces genes, localises dans une region correspondant a une unite de syntenie entre les cmh murin et humain, semblent hautement conserves